Nature communications
2024
De Carluccio G, Fusco V, di Bernardo D
诱导型基因表达系统可通过小分子控制目的基因表达，但常需在低泄漏与高诱导表达之间折中。本文提出一种基于定量合成生物学的替代策略，在不改变转录因子和启动子的前提下，利用合成基因回路降低泄漏并维持高表达。作者通过数学建模比较了相干前馈回路、相互抑制及其组合回路，发现相干抑制回路（CIL）性能最优。据此，将 CRISPR-Cas 内切核酶 ...
Biosensors & bioelectronics
2020
Mukhopadhyay S, Bagh S
面向人类太空旅行的生物工程方案必须将微重力作为关键因素。本文设计、构建并表征了首个基于工程化大肠杆菌基因回路的生化与细胞微重力响应装置，该装置通过改变目标增强绿色荧光蛋白（EGFP）基因的表达来响应微重力。装置原理基于大肠杆菌中 Hfq 蛋白在微重力下发生失调，并利用 Hfq 介导的合成小调控 RNA（SynsrRNA）沉默 EGF...
Molecular systems biology
2016
Schreiber J, Arter M, Lapique N, Haefliger B 等 5 人
构建满足定量性能标准的基因回路是合成生物学的长期挑战。本文提出一种用于优化复杂三基因回路——新型比例型 miRNA 生物传感器——的策略：利用预测模型在传感器遗传组成的相空间中启动搜索，并通过多样化遗传构建模块构建传感器回路库，以获得有利参数组合并发现具有显著改善动态范围的特定遗传组成。高通量筛选数据与少量传感器的详细机制表征数据共...