ACS synthetic biology
2017
Mannan AA, Liu D, Zhang F, Oyarzún DA
代谢物生物传感器是精准工程化代谢的核心工具,但其可调性仍缺乏系统理解。本文研究遗传修饰如何塑造基于代谢物响应转录因子的生物传感器的剂量响应曲线。作者以大肠杆菌 lac 系统为模型,构建了一系列具有不同 LacI 结合 operator 位点的 lacUV5 启动子库,并测量其对 IPTG 的稳态 RFP 荧光响应。结果表明,oper...
Sensors (Basel, Switzerland)
2017
Schuller A, Rödel G, Ostermann K
双氯芬酸是一种广泛使用的非甾体抗炎药,也是水环境中受关注的人为污染物,现有检测多依赖化学和物理方法。本文报道一种基于酿酒酵母 PDR5 启动子的全细胞生物传感器,用于检测双氯芬酸。PDR5 编码参与细胞解毒的多药转运体,其启动子可被双氯芬酸诱导。作者将 PDR5 天然或人工 5′ 上游调控序列与荧光蛋白报告基因 TGFP/TRFP ...
ACS synthetic biology
2017
紧密且可调的基因表达控制是合成生物学构建可预测基因线路和实现理想表型的重要目标。阐明启动子的序列-功能关系对转录水平操纵基因表达尤为关键,尤其适用于依赖转录调控因子的诱导系统。本文采用大规模并行 sort-seq 方法,结合流式细胞分选(FACS)与高通量测序,对大肠杆菌甲醛诱导启动子 Pfrm 进行单核苷酸分辨率分析。将突变甲醛诱...
ACS synthetic biology
2017
Younger AK, Dalvie NC, Rottinghaus AG, Leonard JN
工程微生物工厂的发展受益于生物多样性的挖掘和新型酶途径的高通量合成,但代谢途径的筛选与优化仍是限速步骤。代谢物响应生物传感器可通过监测单个细胞内的代谢物水平并实现代谢物响应反馈控制,帮助解决这些挑战。目前可用的生物传感器主要来自自然进化,难以覆盖许多目标代谢物,因此需要可泛化的新型生物传感器构建方法。本文探索将代谢物结合蛋白转化为代...