Highly multiplexed selection of RNA aptamers against a small molecule library.
合成生物学在人类健康、工业生物生产和生态系统监测中的应用通常需要小分子传感能力，常以遗传编码小分子生物传感器形式实现。为快速开发面向广泛小分子靶标的传感器，本研究利用此前建立的DRIVER方法，对代表高通量药物筛选的密集多路小分子混合物进行RNA生物传感器选择。作者从大型多样性药物筛选库中随机选取5120个靶标化合物，完成95轮选择...
Plant hormone sensors as scaffolds for biosensor design.
生物传感器是药物与代谢物诊断、诱导型基因回路和细胞成像等生物技术的基础，但面向用户定义小分子快速构建传感器仍困难。本文以植物胁迫激素脱落酸（ABA）受体 PYR1 及其磷酸酶 HAB1 构成的化学诱导二聚化（CID）系统为支架，探索其作为可重编程小分子生物传感器平台的普适性。作者通过计算设计在 PYR1 结合口袋引入大量突变，构建突...
Application and analysis of structure-switching aptamers for small molecule quantification.
现代细胞功能分析工具旨在对某一类生物分子的所有成员进行定量测量。在各类分析物中，核酸的测量通常最易实现，既可针对单个分析物，也可并行检测，因此人们希望利用核酸生物传感器来测量其他细胞分子。在众多核酸生物传感器策略中，结构转换适配体（SSA）能够将目标分子识别与信号读出耦合，具有独特优势，但决定其信号保真度的关键参数仍缺乏系统表征。本...