Nature communications
2024
Deng F, Li Y, Yang B, Sang R 等 10 人
本文报道了CRISPR/Cas12a反式切割激活的一种新调控机制:与向导RNA部分匹配的小型环状DNA纳米结构(Cir-mediator)仅能极弱地激活Cas12a核糖核蛋白(RNP),而将其线性化后可恢复激活。基于此,作者建立了自催化Cas12a环状DNA扩增反应(AutoCAR)体系,使单个核酸靶标可激活多个RNP,大幅提高每个...
Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
2023
Deng F, Li Y, Sang R, Zhang C 等 7 人
CRISPR/Cas 生物技术为生物传感器开发提供了高效平台。现有 CRISPR/Cas12a 传感系统虽可用于核酸、小分子、小蛋白和微生物检测,但均依赖 DNA 报告子,限制了进一步应用。本研究建立了一种基于 RNA 报告子的 CRISPR/Cas12a 生物传感系统。基础系统中,Cas12a 与 gRNA 形成核糖核蛋白复合物,...
Talanta
2021
Deng Y, Cao G, Chen X, Yang M 等 6 人
低丰度PIK3CA H1047R基因突变检测对乳腺癌临床诊断和治疗至关重要。本文建立了一种结合级联链置换扩增(C-SDA)与CRISPR/Cas12a反式切割活性的荧光生物传感器,用于超灵敏检测PIK3CA H1047R突变。突变基因片段可与互补序列结合,形成内切酶FspI的完整识别位点;在FspI介导下,突变位点被切割并产生DNA...
Chemical science
2020
Zhou W, Wang L, Liu C, Teng Q 等 6 人
循环肿瘤DNA(ctDNA)的定量检测对液体活检至关重要,但其在体液中含量极低,检测难度大。为满足该需求,作者建立了一种基于镧系配位聚合物(Ln-CPs)定量循环DNA聚合的ctDNA检测方法。首次利用焦磷酸根离子(PPi)与三价铈离子(Ce3+)的配位作用,制备了无有机配体的PPi-Ce配位聚合物网络(PPi-Ce CPNs),其...
The Analyst
2020
Chen C, He R, Zhang Z, Chen Y
本研究开发了一种基于双重识别的荧光生物传感器用于循环肿瘤DNA(ctDNA)检测,结合肽核酸(PNA)的夹持功能与小分子连接DNA末端保护(TPSMLD)策略。以PIK3CA基因肿瘤特异性E542K突变及其甲基化作为目标ctDNA,PNA修饰磁性微球在62°C选择性捕获突变序列,5-甲基胞嘧啶单克隆抗体识别甲基化位点,外切酶I/II...
The Analyst
2020
Liu G, Ma X, Tang Y, Miao P
本文提出一种基于DNA四路连接体(FWJ)的比率荧光生物传感器,用于循环肿瘤DNA(ctDNA)分析。作者首先设计并制备了三个用于构建FWJ的发夹结构燃料链:FWJ1在5′端标记Cy5,FWJ2在3′端标记Dabcyl,FWJ3在5′和3′端分别标记FAM和Dabcyl。形成FWJ所需的另一关键链是由目标ctDNA引发的链置换扩增(...