ACS synthetic biology
2023
Kim J, Lu LC, Gao X, Hofmockel KS 等 6 人
为研究土壤微生物群落在难以成像环境材料中的群落尺度表型,作者评估了模型土壤群落(MSC)中单一成员能否在不破坏基质的情况下被编程报告基因表达。该 MSC 包含 Dyadobacter fermentans、Ensifer adhaerens、Rhodococcus sp003130705、Streptomyces sp0019056...
ACS synthetic biology
2022
Fulk EM, Gao X, Lu LC, Redeker KR 等 6 人
基因表达可在难以成像的环境材料中通过气体报告生物传感器进行监测,但此前应用仅限于经高压灭菌并用富营养培养基水合的基质。为评估指示气体报告与环境样品的相容性,作者研究了基质水合对加入筛分土壤的工程微生物气体信号的影响。当以环境相关渗透压水合时,气体报告微生物在森林土(Alfisol)中产生气体信号。若分析前对气体进行浓缩,10^3 c...
Biosensors & bioelectronics
2020
Liu Y, Guo M, Du R, Chi J 等 9 人
荧光蛋白作为光学报告元件被广泛用于全细胞微生物生物传感器,但在土壤等不透明介质中应用受限。本研究提出一种以气体为报告信号的快速现场检测土壤汞污染的方法。该生物传感器中,MerR蛋白可捕获汞离子并结合efe基因启动子,启动乙烯(C2H4)生成酶的表达,从而产生气体。研究表明,汞离子浓度可转化为C2H4气体信号,并用手持式C2H4传感器...
ACS synthetic biology
2018
Cheng HY, Masiello CA, Del Valle I, Gao X 等 6 人
荧光蛋白广泛用于监测天然与合成基因回路,但只能用于透明体系,难以在土壤和沉积物等不透明基质中非破坏性测量基因表达。本文提出一种比值型气体报告方法,用于在难以成像的环境基质中连续监测基因表达。该方法中,乙烯形成酶(EFE)组成型表达并持续合成乙烯(C2H4),用于指示活菌数量;甲基卤化物转移酶(MHT)基因置于条件启动子控制下,在目标...