Molecular dynamics simulations reveal mechanistic insights into aptamer-induced structural rearrangements in viral capsid proteins.

罗氏沼虾杆状病毒（Macrobrachium rosenbergii nodavirus, MrNV）是引起巨淡水对虾白尾病的主要病毒，造成严重经济损失。本研究考察截短 DNA 适配体 TrAptm-1 对 MrNV 衣壳蛋白单体和三聚体形式的结合特性。分子动力学模拟结合 MM/PBSA 结合自由能计算表明，TrAptm-1 与三聚...