Protein Transport through Nanopores Illuminated by Long-Time-Scale Simulations.

分子在纳米受限空间中的传输对生物学、生物传感和工业过滤具有重要意义。现有模拟因时间尺度短、重复次数少而难以获得统计可靠结论。本文提出一种高通量计算框架，将布朗动力学（BD）与基于Poisson–Nernst–Planck–Stokes（PNPS）方程的连续介质模拟相结合，在实验真实条件下模拟数百条长达秒级的蛋白质跨孔轨迹，并同时计入...