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RE-SELEX: restriction enzyme-based evolution of structure-switching aptamer biosensors.

Chemical science 2021 Sanford AA, Rangel AE, Feagin TA, Lowery RG 等 6 人

适配体因能高亲和、高选择识别小分子,被广泛用于小分子生物传感器。结构切换适配体可将靶标诱导的构象变化直接转化为功能输出,但传统SELEX通常不筛选产生显著构象变化所需的序列,已有修饰选择方法又受固定化步骤限制。本文报道一种基于限制性内切酶的同相结构切换适配体选择方法(RE-SELEX),利用EcoRI-HF对双链识别位点的切割活性,...

Probing the Mechanism of Structure-Switching Aptamer Assembly by Super-Resolution Localization of Individual DNA Molecules.

Analytical chemistry 2020 Lackey HH, Peterson EM, Harris JM, Heemstra JM

寡核苷酸适配体可通过引入一段通常带标记的互补短寡核苷酸,转化为结构切换型生物传感器;靶标结合会破坏适配体与标记互补链之间的杂交平衡,从而产生与靶标浓度相关的信号。尽管该机制对传感器性能至关重要,多数结构切换适配体的分析物响应机制仍不清楚。本文采用单分子荧光成像研究标记互补寡核苷酸与未标记小分子靶标 L-酪氨酰胺(L-Tym)同 L-...