EPI-peptide designer: a tool for designing peptide ligand libraries based on epitope-paratope interactions.

抗体是重要的生物药物，但存在药代动力学不佳、免疫原性高和生产成本高等局限。高亲和力和高特异性的合成肽可作为抗体的替代，但目前缺乏指导此类肽设计的计算工具。本文提出一种基于表位-表位点相互作用（EPI）模式的计算设计方法。作者利用界面相互作用残基（I2R）方法，从蛋白质数据银行中的抗体-抗原复合物结构中提取参与分子相互作用的残基，并将...