Bacillus subtilis var. natto as a naturally optimized biotin biosensor.
枯草芽孢杆菌纳豆变种（Bacillus subtilis var. natto）是传统大豆发酵中广泛使用的天然生物素营养缺陷型菌株。本研究评估其作为无需基因改造的微生物生物素生物传感器的潜力。采用双层琼脂扩散法，在 Spizizen 最小培养基平板中检测 0.001–200 mg/L 生物素浓度下的生长响应。结果显示，菌体周围生长晕...
Development of
含硫氨基酸甲硫氨酸和半胱氨酸在食品工业中重要，可赋予食品硫味或肉香，并参与乳发酵风味形成；切达奶酪特征风味即来源于甲硫氨酸。因此，能过量产生并分泌这些氨基酸的菌株具有应用价值。然而，食品基质中定量这些化合物通常繁琐，需要样品制备和高效液相色谱等方法。细菌天然感知代谢物的能力已被用于开发生物传感器，即特定代谢物被感知后转化为报告基因表...
Design and characterization of auxotrophy-based amino acid biosensors.
本研究开发了一套基于大肠杆菌营养缺陷型的全细胞生物传感器阵列，用于高效、低成本地高通量定量生理体液或微生物培养物中的氨基酸。作者利用在线数据库进行理性设计，筛选氨基酸生物合成途径末端基因，预测其单基因缺失可产生对特定氨基酸的营养缺陷型。针对精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、苏氨酸、色氨酸和酪氨酸，...
Computational design of auxotrophy-dependent microbial biosensors for combinatorial metabolic engineering experiments.
组合代谢工程通过在大肠杆菌等微生物群体中产生遗传多样性，并筛选具有改善表型的菌株，以构建高产量化学品生产菌株。该领域的主要瓶颈是许多目标化学品缺乏易于识别的表型特征，导致高通量筛选昂贵且耗时。为此，已有研究提出利用微生物生物传感器检测并量化目标化学品。本文提出新的计算方法：第一，基于底物营养缺陷型理性设计微生物生物传感器，使工程菌的...