Parallel tempering Monte Carlo simulations of lysozyme orientation on charged surfaces.
本文提出并行退火蒙特卡洛(PTMC)算法,用于在单次模拟中准确、高效地识别吸附在表面上的蛋白的全局最低能量取向。以溶菌酶为模型蛋白,研究其在带电表面上的吸附取向。结果表明,溶菌酶可较容易地吸附在负电荷表面上,并呈现“侧向”(side-on)和“背向”(back-on)两种取向。当静电相互作用占主导时,溶菌酶倾向于以侧向方式吸附,其活...