PloS one
2020
Dabirian Y, Skrekas C, David F, Siewers V
烷烃类生物燃料因性质接近石油基交通燃料而具有商业生产价值,但通过工程微生物高效生产烷烃仍具挑战。代谢工程常结合进化工程与高通量筛选工具,包括代谢物生物传感器,以识别高产细胞。将酿酒酵母工程化生产烷烃可借助烷烃响应生物传感器,其可能来源于已知烷烃同化酵母解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)的天然烷烃感应系统。该系统至...
Biosensors & bioelectronics
2020
Dey S, Baba SA, Bhatt A, Dhyani R 等 5 人
十二烷基硫酸钠(SDS)广泛用于家庭、农业和工业,其废水排放对水生生物和饮用水安全构成威胁,因此需要高效、特异且简便的环境监测方法。本研究利用铜绿假单胞菌 PAO1 中 sdsA1 基因的 SDS 响应启动子及其激活蛋白 sdsB1,与绿色荧光蛋白(GFP)报告基因构建新型全细胞荧光生物传感器。当 SDS 存在时,sdsB1 与 S...
Angewandte Chemie (International ed. in English)
2020
Chern M, Garden PM, Baer RC, Galagan JE 等 5 人
近期,变构转录因子(TF)被鉴定为体外传感中一类新型生物识别元件:通过指示TF与其对应DNA之间结合亲和力的差异,可表现出对分析物的剂量依赖性响应。本文报道了一种模块化微球生物传感器设计,可应用于TF-DNA-分析物体系。DNA功能化微球可实现高效混合与空间分离;标记有TF的半导体量子点(QD)则作为明亮荧光指示剂,分别指示TF-D...
ACS applied materials & interfaces
2020
Chen M, Grazon C, Sensharma P, Nguyen TT 等 14 人
将生物传感器固定于功能材料中是实现器件开发与可穿戴技术转化的关键。本文报道并评估了一种固定化的量子点–转录因子–核酸复合物,用于孕酮检测,作为器件集成的初步步骤。该传感器由多组氨酸标签转录因子、量子点和荧光标记同源DNA组成,并嵌入水凝胶固定基质中。水凝胶光学透明、柔软且柔韧,可截留量子点–转录因子–DNA组装体,同时允许被测物孕酮...
Frontiers in cell and developmental biology
2020
Li H, Wang Q, Zhao R, Wang Y 等 6 人
他汀是广泛使用的降胆固醇药物,其个体疗效差异可能与人类HMG-CoA还原酶(hHMGR)变异有关。本文报道了两种大肠杆菌全细胞生物传感器的设计与构建。第一种为他汀疗效检测传感器,由混合甲羟戊酸(MVA)通路模块和HMG-CoA传感模块组成:截短人源hHMGR(thHMGR)作为MVA通路关键酶,枯草芽孢杆菌FapR(BsFapR)作...
Biotechnology and applied biochemistry
2020
Zhang X, Cao Y, Liu Y, Liu L 等 7 人
基于转录因子(TF)的代谢物响应型生物传感器是筛选工程酶和动态调控生物合成途径的重要工具,但 TF 结合位点插入常影响启动子活性,且最优 TF 表达水平难以预测。本研究以枯草芽孢杆菌中 N-乙酰神经氨酸(NeuAc)生物传感器为案例,建立分步构建策略。首先筛选 12 个不同强度启动子构建第一启动子库;随后将大肠杆菌 NanR 结合序...
Trends in biotechnology
2020
天然产物在微生物细胞工厂中的低产率和低滴度是生物合成中的常见瓶颈。设计遗传生物传感器以监测和调控目标天然产物的合成,是解决该问题的重要策略。本综述系统评价了微生物天然产物生物合成中遗传生物传感器设计的最新进展,重点讨论了遗传部件选择策略与构建原则,包括转录因子(TF)和核糖开关作为传感装置、报告基因或通路基因作为转导装置,以及启动子...
Frontiers in bioengineering and biotechnology
2020
Li JW, Zhang XY, Wu H, Bai YP
本文综述了转录因子(TF)在微生物代谢工程与有机酸生物生产中的识别、工程化及应用。TF 可识别特定 DNA 序列并响应胞内外小分子、信号和刺激,是构建遗传编码生物传感器的关键元件,用于监测有机酸生产中原本“不可见”的胞内代谢物浓度。TF 型生物传感器可将代谢物浓度转化为荧光等可检测信号,并与流式细胞分选(FACS)等高通量筛选技术结...
ACS synthetic biology
2020
Silverman AD, Akova U, Alam KK, Jewett MC 等 5 人
近期无细胞合成生物学进展推动了体外分子诊断的发展,使其成为全细胞生物传感器的有效替代。然而,用于检测农药等人工有机水污染物的无细胞传感器仍较少,部分原因是可直接检测此类污染物的已表征天然生物传感器有限。本文提出一种无细胞检测关键水污染物莠草津(atrazine)的平台,将已表征的氰尿酸(cyanuric acid, CYA)生物传感...
ACS synthetic biology
2020
Ambri F, D'Ambrosio V, Di Blasi R, Maury J 等 8 人
本文报道了一种用于酵母全细胞生物传感器报告启动子的高分辨率扫描策略。作者以酿酒酵母为宿主,构建 VanO、BenO 和 PcaO 操作子在不同位置相对转录起始位点排列的启动子文库,分别由 pTEF1 或 pCYC1 启动子骨架承载,并驱动绿色荧光蛋白(GFP)报告基因表达。通过引入转录因子 VanR、BenM 和 PcaQ,研究香草...