5 条结果 关键词:转录组分析 ×

Coupling genome-wide continuous perturbation with biosensor screening reveals the potential targets in yeast isopentanol synthesis network.

Synthetic and systems biotechnology 2025 Xiao Q, Shi J, Wang L, Zhao G 等 5 人

化石燃料消耗加剧资源枯竭与环境污染,异戊醇、异丁醇等支链高级醇因性质接近汽油而成为下一代生物燃料候选。微生物发酵可提供绿色、可持续、可再生的替代路线,但异戊醇发酵产率尚未达到工业规模。本研究利用可诱导碱基编辑工具 Helicase-AID 构建基因组尺度连续扰动库,并结合异戊醇生物传感器进行高通量筛选,获得五个高产突变体。突变体均表...

Genome-Wide Gene Expression Analysis Reveals Unique Genes Signatures of Epithelial Reorganization in Primary Airway Epithelium Induced by Type-I, -II and -III Interferons.

Biosensors 2022 Erb A, Zissler UM, Oelsner M, Chaker AM 等 6 人

生物传感器如Toll样受体(TLR)在病毒感染后诱导干扰素(IFN)表达,是细胞内在宿主防御的第一步,但其对上皮完整性基因的差异影响仍不清楚。本研究采用全基因组基因表达生物传感器芯片(微阵列)检测I型、II型和III型IFN刺激对原代类器官三维气-液界面气道培养上皮表达谱的影响。结果显示,所有IFN均诱导相似的干扰素刺激基因(ISG...

Analyzing the genetic characteristics of a tryptophan-overproducing Escherichia coli.

Bioprocess and biosystems engineering 2021

大肠杆菌中 L-色氨酸(L-Trp)生产长期依赖随机诱变与筛选,但所得菌株遗传背景不清。本研究将细胞内 L-Trp 生物传感器与流式细胞分选(FACS)结合,在大肠杆菌中筛选获得 L-Trp 高产株 TPD5,并系统阐明其过量生产的遗传基础。全基因组测序鉴定出多个突变,其中影响最显著的正向突变包括 TnaA 缺失、AroG S211...

Development of

Frontiers in microbiology 2020 Hernandez-Valdes JA, Solopova A, Kuipers OP

发酵细菌的某些次级代谢物是食品工业所需化合物,如乳酸菌产生的二乙酰和乙醛。二乙酰赋予乳制品黄油风味,乙醛与酸奶风味和香气相关。这些化合物在食品基质中的定量通常需要繁琐的样品前处理和专门分析方法。细菌天然感知代谢物的能力已被用于开发生物传感器,使特定代谢物的存在被识别并转化为报告基因表达。本研究旨在开发基于荧光的生物传感器检测二乙酰和...

Chromosome 18 transcriptome profiling and targeted proteome mapping in depleted plasma, liver tissue and HepG2 cells.

Journal of proteome research 2013 Zgoda VG, Kopylov AT, Tikhonova OV, Moisa AA 等 28 人

俄罗斯染色体中心人类蛋白质组计划(C-HPP)的最终目标是在去高丰度蛋白血浆、肝组织和HepG2细胞中分析第18染色体(Chr18)蛋白组成,目标灵敏度为10−18 M。作者利用选择反应监测(SRM)对277个Chr18蛋白进行靶向检测,并据此为250个蛋白建立SRM检测方案:41个仅在肝组织检出,82个仅在去高丰度蛋白血浆检出,1...