转录因子（TFs）通过结合特定信号分子（SMs）启动转录，但设计能精确识别非天然信号分子的 TFs 仍具挑战。本研究以转录激活因子 BmoR 为例，建立基于随机森林的机器学习模型 BT，用于预测决定信号分子正交性的三个关键残基区（CRRs）。作者利用 Discovery Studio 对 5700 个 BmoR 突变体与四种醇类信号...
3-甲基-1-丁醇（3MB，又称异戊醇）是新兴的生物基溶剂、平台化学品和高级生物燃料候选物，在化工、能源和消费品领域需求持续增长。微生物合成提供了替代石化路线的可持续途径，但受途径复杂性、副产物形成、氧化还原失衡和产品毒性限制，工业可行浓度仍具挑战。本综述系统总结微生物 3MB 生产的最新进展，包括宿主菌株与途径工程、原料多样化和发...
化石燃料消耗加剧资源枯竭与环境污染，异戊醇、异丁醇等支链高级醇因性质接近汽油而成为下一代生物燃料候选。微生物发酵可提供绿色、可持续、可再生的替代路线，但异戊醇发酵产率尚未达到工业规模。本研究利用可诱导碱基编辑工具 Helicase-AID 构建基因组尺度连续扰动库，并结合异戊醇生物传感器进行高通量筛选，获得五个高产突变体。突变体均表...
支链氨基酸（BCAA）代谢具有多种生理功能，并可被用于生产高价值化学品。然而，目前缺乏特异性针对 BCAA 衍生产物的真核生物传感器，限制了用于菌株工程与代谢研究的高通量筛选的发展。本研究利用酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）转录调控因子 Leu3p 开发了一种遗传编码的 BCAA 代谢生物传感器。在一种构...
短链醇的生物合成是替代石油基燃料的碳中性途径，但大规模菌株筛选长期受限于气相色谱、液相色谱等繁琐分析。本文以假单胞菌 Pseudomonas putida GPo1 的转录因子 AlkS 及其同源启动子 PalkB 为基础，通过错误 PCR 随机突变、流式分选富集和位点饱和突变等定向进化策略，构建并表征了可识别正丁醇、异戊醇、异丁醇...