CHARMM force field generation for a cationic thiophene oligomer with ffTK.
本研究针对具有生物分子传感潜力的阳离子噻吩低聚物 N,N,N-三甲基-3-(4-甲基噻吩-3-基氧基)丙烷-1-铵,生成了与其分子动力学模拟兼容的 CHARMM 力场参数。作者采用 VMD 中的 ffTK 插件,并结合 Gaussian09 量子化学计算,确定 Lennard-Jones 参数、部分电荷、键、角和二面体参数。随后,对...
本研究针对具有生物分子传感潜力的阳离子噻吩低聚物 N,N,N-三甲基-3-(4-甲基噻吩-3-基氧基)丙烷-1-铵,生成了与其分子动力学模拟兼容的 CHARMM 力场参数。作者采用 VMD 中的 ffTK 插件,并结合 Gaussian09 量子化学计算,确定 Lennard-Jones 参数、部分电荷、键、角和二面体参数。随后,对...
本文报道了一种用于超灵敏检测凝血酶的比色适配体传感器。该体系以阳离子聚噻吩衍生物 PMNT 作为 3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)–H2O2 反应的催化剂,以凝血酶结合适配体(TBA)作为诱导聚合物构象变化的识别元件。PMNT 在 H2O2 存在下可催化 TMB 氧化生成蓝色产物,其催化活性与 PMNT 构象密切相关。TB...
大多数微生物颗粒表面在中性 pH 下带负电荷。本文报道一种基于水溶性阳离子聚噻吩衍生物 AH-35 的荧光生物传感器,用于快速评估水中微生物污染。作者以大肠杆菌(Escherichia coli, E. coli)作为原型微生物颗粒,将 AH-35 加入水样后,利用其阳离子链与细菌表面负电荷超微结构之间的静电相互作用,使聚合物发生结...