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Modeling a synthetic aptamer-based riboswitch biosensor sensitive to low hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX) concentrations.

PloS one 2020 Mayo ML, Eberly JO, Crocker FH, Indest KJ

RNA适配体是较短的核酸序列,可高亲和性结合靶标;当与能够启动荧光报告蛋白翻译的核糖开关组合时,可用于多种介质中的化学检测。该过程从分子尺度的靶标结合延伸到宏观尺度的荧光检测,涉及多个限速的物理变化(如分子构象变化)和生化变化(如反应速率),使检测设计复杂。本文描述了一个用于辅助环境检测六氢-1,3,5-三硝基-1,3,5-三嗪(R...

A novel RNA aptamer-modified riboswitch as chemical sensor.

Analytica chimica acta 2020 Wang J, Yang D, Guo X, Song Q 等 6 人

本研究开发了一种新型无标记、无固定化的RNA适配体修饰核糖开关生物传感器,利用RNA适配体修饰的二级结构支架控制核糖体结合序列(RBS)的可及性。将双链RNA适配体修饰的顺式抑制序列(crRNA)引入指示基因gfp的上游,由于发夹结构中RNA适配体序列不互补,形成RNA泡。无目标分子时,RBS被crRNA隐藏,核糖体无法识别,gfp...