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TFBMiner: A User-Friendly Command Line Tool for the Rapid Mining of Transcription Factor-Based Biosensors.

ACS synthetic biology 2023 Hanko EKR, Joosab Noor Mahomed TA, Stoney RA, Breitling R

响应小分子的转录因子是合成生物学设计中的关键元件,常作为遗传编码生物传感器,用于环境污染物和生物标志物检测以及微生物菌株工程。尽管已有多种策略扩展可检测化合物范围,但转录因子及其诱导分子的鉴定与表征仍费时费力。本文提出 TFBMiner,一种用户友好的命令行数据挖掘与分析流程,可自动、快速鉴定潜在的代谢物响应型转录因子生物传感器(T...