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Electrochemical SELEX Technique for the Selection of DNA Aptamers against the Small Molecule 11-Deoxycortisol.

ACS applied bio materials 2019 Eissa S, Siddiqua A, Chinnappan R, Zourob M

适配体因高亲和性和特异性成为重要生物识别受体,但传统SELEX选择过程繁琐、昂贵且耗时,限制其广泛应用。本文设计了一种电化学SELEX平台,用于快速、高效、低成本地富集和识别小分子适配体。该平台将目标分析物共价固定于金电极表面,提高选择效率,并可通过方波伏安法原位监测富集DNA。与传统SELEX相比,该方法避免使用固相微珠和荧光标记...

An in Vitro Selection Strategy Identifying Naked DNA That Localizes to Cell Nuclei.

Journal of the American Chemical Society 2019 Smestad J, Wilbanks B, Maher LJ

组合化学通过随机文库扩增筛选出能结合靶分子的适配体,但适配体穿过细胞膜并进入特定亚细胞区室仍是化学生物学难题。本文提出一种体外筛选策略,利用DNA连接酶奖励型生物传感器从约10^14多样性的随机DNA文库中筛选可自主归巢至培养细胞细胞核的裸DNA适配体。该传感器由随机DNA文库、5′-磷酸化诱饵寡核苷酸和支架寡核苷酸杂交形成,缺口位...

Artificial Caprolactam-Specific Riboswitch as an Intracellular Metabolite Sensor.

ACS synthetic biology 2019 Jang S, Jang S, Im DK, Kang TJ 等 6 人

己内酰胺是合成尼龙-6的单体,近期已开发用于生物基生产尼龙-6的重组微生物菌株。胞内己内酰胺生物传感器可促进重组微生物菌株的高通量代谢工程。由于重组菌株会混合生产己内酰胺和戊内酰胺,己内酰胺传感器必须对己内酰胺具有高特异性,但此前尚未报道高特异性己内酰胺传感器。本文开发了一种特异性响应己内酰胺的人工核糖开关。该核糖开关采用体外-体内...

Selection of high affinity aptamer-ligand for dexamethasone and its electrochemical biosensor.

Scientific reports 2019 Mehennaoui S, Poorahong S, Jimenez GC, Siaj M

本研究报道了一种用于检测地塞米松(DXN)的高亲和力适配体及其无标记电化学阻抗适配体传感器。作者采用指数富集系统进化(SELEX)技术,从1.08×10^15条随机单链DNA库中筛选出适配体DEX04,其解离常数KD为18.35 nM,并与DXN结合后发生明显构象变化,且对孕酮、诺孕酯和雌二醇等类似激素无交叉反应。随后将二硫键修饰的...

Recent Advances in Aptamer Discovery and Applications.

Molecules (Basel, Switzerland) 2019 Zhang Y, Lai BS, Juhas M

适配体是短单链 DNA、RNA 或合成 XNA 分子,可通过体外筛选获得,以高亲和力和高特异性识别几乎任何目标分子。它们已广泛用于基础研究发现、食品安全保障和环境监测,并在临床诊断和治疗中展现出应用前景。本综述更新该快速进展领域的最新进展,重点介绍适配体的生成方法及其在生物传感、生物技术和医学中的应用。文章还讨论了适配体在靶标特异性...

综述或非传感器论文 适配体SELEX生物传感器诊断

Focusing aptamer selection on the glycan structure of prostate-specific antigen: Toward more specific detection of prostate cancer.

Biosensors & bioelectronics 2019 Díaz-Fernández A, Miranda-Castro R, de-Los-Santos-Álvarez N, Rodríguez EF 等 5 人

开发能够检测蛋白质特定糖基化模式的化学传感器,为癌症早期检测提供了有力手段。然而,由于识别蛋白所连糖链的受体难以发现,这一策略很少被探索。本文描述了一种简单方法,可将适配体选择导向糖蛋白的糖结构,并以前列腺特异性抗原(PSA)为模型靶标。利用该策略,我们鉴定到一个适配体(PSA-1),它以合理亲和力结合 PSA 的糖基部分(解离常数...

In vitro selection of CD70 binding aptamer and its application in a biosensor design for sensitive detection of SKOV-3 ovarian cells.

Talanta 2019 Bayat P, Taghdisi SM, Rafatpanah H, Abnous K 等 5 人

本研究通过系统进化指数富集(SELEX)技术筛选识别肿瘤细胞表面过表达分子 CD70 的单链 DNA 适配体。研究同时采用纯化 CD70 蛋白和表达 CD70 的细胞作为靶标,先进行 10 轮蛋白 SELEX,再进行 7 轮细胞 SELEX,最终获得对 CD70 具有高亲和力和高特异性的适配体 Apt928。实验表明,Apt928 ...

An in Vitro-Selected DNAzyme Mutant Highly Specific for Na

Chembiochem : a European journal of chemical biology 2019 Ma L, Liu J

钠是生物体系中最常见的金属离子之一,但基于DNA的钠探针直到近期才被报道。NaA43是一种仅由Na+激活的Na+特异性RNA切割DNAzyme。本研究以六氨合钴(III)(Co(NH3)63+)作为预期金属辅因子进行体外筛选,却获得NaA43的突变体NaH1,二者仅相差两个核苷酸。NaA43的最适pH为7.0,而NaH1的最适pH为...

荧光生物传感器 钠离子DNAzymeSELEX弱酸性