Generation of small molecule-binding RNA arrays and their application to fluorogen-binding RNA aptamers.

Methods (San Diego, Calif.) 2019 Henderson CA, Rail CA, Butt LE, Vincent HA 等 5 人

RNA功能的不断拓展凸显了靶向RNA的小分子的价值。近年来，多种荧光素结合RNA适配体被开发出来，可作为RNA标签或分子生物传感器，用于活细胞中RNA和代谢物的成像。尽管这类荧光素结合RNA适配体装置在理论上设计简单，但实际应用中需要仔细优化。因此，能够定量荧光素与RNA适配体相互作用的高通量体外筛选技术具有重要价值。作者近期建立了...

荧光生物传感器 RNA阵列荧光素结合RNA适配体孔雀石绿适配体Spinach

Development of a genetically encodable FRET system using fluorescent RNA aptamers.

Nature communications 2018 Jepsen MDE, Sparvath SM, Nielsen TB, Langvad AH 等 7 人

荧光RNA适配体可用于细胞内RNA分子追踪和生物传感器构建。基于荧光蛋白的FRET已用于检测构象变化，但尚未用于荧光RNA适配体。本文利用单链RNA折纸支架开发了基于RNA适配体的FRET（apta-FRET）系统。为实现FRET，将Spinach和Mango荧光适配体在RNA支架上近距离排列，并合成新荧光团YO3-biotin以提...

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