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Using the QCM Biosensor-Based T7 Phage Display Combined with Bioinformatics Analysis for Target Identification of Bioactive Small Molecule.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2018 Takakusagi Y, Takakusagi K, Sugawara F, Sakaguchi K

直接结合生物活性小分子的靶蛋白鉴定对于阐明小分子作用机制和分子水平生物学现象具有重要意义。T7噬菌体展示技术可在T7噬菌体衣壳上展示随机肽库,从而全面筛选识别小分子的氨基酸序列。本文描述了一种将T7噬菌体展示与石英晶体微天平(QCM)生物传感器相结合的亲和筛选平台,并辅以生物信息学分析,用于鉴定识别小分子的短肽。该方法无需反复多轮生...

Multimodal biopanning of T7 phage-displayed peptides reveals angiomotin as a potential receptor of the anti-angiogenic macrolide Roxithromycin.

European journal of medicinal chemistry 2015 Takakusagi K, Takakusagi Y, Suzuki T, Toizaki A 等 13 人

罗红霉素(RXM)是一种具有抗肿瘤血管生成活性的半合成十四元大环内酯抗生素。本研究采用三种模式对T7噬菌体展示肽进行生物筛选:96孔微孔板、流动注射型石英晶体微天平(QCM)生物传感器和比色皿型QCM。不同筛选模式获得序列、长度和数量不同的RXM识别肽。对RXM筛选肽的生物信息学分析一致显示血管生成素(Amot)胞外域(E458–T...

Mapping a disordered portion of the Brz2001-binding site on a plant monooxygenase, DWARF4, using a quartz-crystal microbalance biosensor-based T7 phage display.

Assay and drug development technologies 2013 Takakusagi Y, Manita D, Kusayanagi T, Izaguirre-Carbonell J 等 10 人

在小分子/蛋白质相互作用研究中,小分子溶解度低或蛋白样品量不足常限制研究进展。本文报道基于石英晶体微天平(QCM)生物传感器的 T7 噬菌体展示方法,并结合受体-配体接触(RELIC)生物信息服务器,应用于植物 Brz2001/DWARF4 体系。Brz2001 是油菜素内酯合成抑制剂,属溶解度较低的三唑类化合物,靶向含血红素和铁的...

Identification of a methotrexate-binding peptide from a T7 phage display screen using a QCM device.

Bioorganic & medicinal chemistry 2008 Takakusagi Y, Kuroiwa Y, Sugawara F, Sakaguchi K

本文报道利用石英晶体微天平(QCM)生物传感器结合 T7 噬菌体展示技术,从随机肽库中筛选并鉴定出一种可结合甲氨蝶呤(MTX)的 11 肽 SIFPLCNSGAL。将生物素化 MTX 固定于亲和素修饰的陶瓷 QCM 金电极表面,注入 T7 噬菌体肽库后,结合噬菌体使晶体表面质量增加,引起频率下降;经多轮筛选可富集 MTX 结合噬菌体...