压电(QCM)生物传感器 2008

Identification of a methotrexate-binding peptide from a T7 phage display screen using a QCM device.

Bioorganic & medicinal chemistry Takakusagi Y, Kuroiwa Y, Sugawara F, Sakaguchi K
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组成图示

Identification of a methotrexate-bind... 传感器构成示意图

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传感器类型

压电(QCM)生物传感器

检测对象

甲氨蝶呤结合肽(methotrexate-binding peptide, SIFPLCNSGAL)、T7 噬菌体展示肽库(T7 phage pool);样品基质:T7 噬菌体展示库溶液、SPR 缓冲液(MTX/叶酸)

检测原理

QCM 筛选中,生物素化 MTX 经亲和素固定于陶瓷 QCM 金电极表面。注入 T7 噬菌体肽库后,展示 MTX 结合肽的噬菌体与固定化 MTX 特异性结合,使晶体表面质量增加,依据 Sauerbrey 效应引起频率下降;结合量越大或亲和力越强,频率变化越明显。多轮筛选使结合噬菌体富集,传感器图显示结合量与结合速率逐轮增加。SPR 验证中,合成肽通过氨基偶联固定于 CM5 芯片,MTX 浓度 3.13–50 µM 时响应随浓度增加,表观 KD 为 2.23×10^-5 M;叶酸不结合,说明肽识别 MTX 的 N-甲基化锁定 L 形构象。

检测灵敏度

未报告 LOD、线性范围、灵敏度斜率或 R^2;SPR 报告表观 KD: 2.23 × 10^-5 M,MTX 浓度范围: 3.13–50 µM。

效应效果

QCM 筛选中,T7 噬菌体库注入后频率下降,多轮筛选后结合噬菌体量和结合速率增加,表明 MTX 结合噬菌体被富集。96 孔板验证中,SIFPLCNSGAL 单克隆噬菌体滴度比最高(20 倍),而富集比例最低(2/46),说明其特异性结合 MTX。SPR 显示合成肽选择性结合 MTX,表观 KD 为 2.23×10^-5 M,对叶酸无结合。文中未报告稳定性、RSD 或实际样品回收率。作者认为该方法可克服小分子固定化限制,用于发现弱结合靶蛋白。

传感器的构成

  • 换能器基底:陶瓷 QCM 芯片(27 MHz)与金电极,提供压电换能及表面固定
  • 修饰层:亲和素(avidin)涂覆于金电极,通过生物素–亲和素作用固定 MTX-biotin
  • 识别元件:生物素化甲氨蝶呤(MTX-biotin,1:1 混合物),特异性捕获展示 MTX 结合肽的 T7 噬菌体
  • 信号标记:T7 噬菌体颗粒(T7 phage pool),展示 SIFPLCNSGAL 等候选肽并作为质量标记
  • 读出系统:QCM 频率监测,噬菌体结合导致表面质量增加和频率下降

中文摘要

本文报道利用石英晶体微天平(QCM)生物传感器结合 T7 噬菌体展示技术,从随机肽库中筛选并鉴定出一种可结合甲氨蝶呤(MTX)的 11 肽 SIFPLCNSGAL。将生物素化 MTX 固定于亲和素修饰的陶瓷 QCM 金电极表面,注入 T7 噬菌体肽库后,结合噬菌体使晶体表面质量增加,引起频率下降;经多轮筛选可富集 MTX 结合噬菌体。随后通过 96 孔板噬菌体展示实验和表面等离子共振(SPR)分析验证候选肽的结合特性。SPR 结果显示,合成肽与 MTX 呈弱结合,表观解离常数 KD 为 2.23×10^-5 M,而对叶酸无结合,表明该肽可识别 MTX 特有的 L 形构象。序列分析发现该肽与二氢叶酸还原酶(DHFR)的 MTX 结合位点残基相似,提示其包含识别 MTX 的关键序列信息,可用于寻找潜在 MTX 结合蛋白。

英文摘要

An 11-mer unique peptide sequence SIFPLCNSGAL was identified as a methotrexate (MTX)-binding peptide from a T7 phage display screen using a quartz-crystal microbalance (QCM) biosensor. The synthetic peptide displayed weak interaction with MTX (K(D) 2.23x10(-5) M) using surface plasmon resonance (SPR). Interestingly, analysis of the primary amino acid sequence of the peptide identified similarities to the MTX-binding site of dihydrofolate reductase (DHFR). Our results highlight the importance of this primary sequence for the recognition of the MTX molecule.

关键词

甲氨蝶呤T7噬菌体展示QCM生物传感器SPR结合肽二氢叶酸还原酶