Dynamics design of a non-natural transcription factor responding to androst-4-ene-3,17-dione.

Synthetic and systems biotechnology 2024 Zhao M, Hu M, Han R, Ye C 等 9 人

甾体微生物细胞工厂生产雄烯二酮（androst-4-ene-3,17-dione，AD）需要转录因子（TFs）参与代谢调控。然而，微生物细胞工厂缺乏可有效响应其代谢途径中 AD 的转录因子，且寻找和获得特异性响应 AD 的天然转录因子是一项复杂而繁重的任务。本研究基于结构引导的分子动力学（MD）模拟，设计了一种响应 AD 的人工转录...

全细胞生物传感器 人工转录因子雄烯二酮酵母生物传感器分子动力学

Computational design of G Protein-Coupled Receptor allosteric signal transductions.

Nature chemical biology 2020 Chen KM, Keri D, Barth P

膜受体将胞外刺激转化为胞内信号，但其分子机制仍不清楚。本文报道了一种用于设计蛋白别构信号功能的计算方法。该方法结合分子动力学模拟与 Rosetta 设计计算，在别构位点工程化氨基酸“微开关”，通过调节受体构象稳定性或长程结构耦合，重新编程特定信号特性。作者设计了 36 个多巴胺 D2 受体变体，其组成型活性和配体诱导信号与预测高度一...

全细胞生物传感器 GPCR别构信号蛋白设计多巴胺D2受体