In-silico selection of peptides for the recognition of imidacloprid.
本文旨在通过计算筛选低成本肽受体，用于环境中新污染物农药的灵敏检测。作者以蛋白数据银行中 Lymnaea stagnalis 乙酰胆碱结合蛋白 Q55R 突变体与吡虫啉复合物（PDB: 3WTH）为起点，利用 PLIP 分析农药与 A、B、C 链相互作用区，选取三条短肽 YSP09、DRM12 和 WQW13。分子对接显示三者可与吡...
Detection of Various Traditional Chinese Medicinal Metabolites as Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitors: Molecular Docking, Activity Testing, and Surface Plasmon Resonance Approaches.
血管紧张素转换酶1（ACE1）通过催化血管紧张素I转化为具有缩血管作用的血管紧张素II，参与体液和血压调节。已有研究表明，部分天然来源化合物可抑制血管紧张素转换酶活性并发挥降压作用。表面等离子共振（SPR）生物传感器技术是观察生物分子相互作用的行业标准方法。本研究采用分子模拟方法评估多种中药代谢物与ACE1蛋白的对接能，利用SPR实...
Production of codon-optimized Factor C fragment from Tachypleus gigas in the Pichia pastoris GS115 expression system for endotoxin detection.
Factor C（FC）是内毒素检测常用标准材料，作为酶原丝氨酸蛋白酶可充当检测脂多糖（LPS）的生物传感器。前期模拟显示 FC 的 C 型凝集素结构域（CLECT）与脂质 A 相互作用。本研究通过蛋白建模、分子对接、分子动力学模拟及 pPIC9K 载体构建，评估 FC 片段与脂质 A 的相互作用稳定性。三个建模网站所得 FC 模型...
Protegrin-2, a potential inhibitor for targeting SARS-CoV-2 main protease M
本研究旨在寻找针对 SARS-CoV-2 主蛋白酶 Mpro（3CL protease）的有效抑制剂，以应对持续传播的病毒变异株。作者从抗菌肽数据库筛选约 200 个抗菌肽，采用分子对接、过敏原性和毒性预测等计算方法进行初筛，并选取候选肽进行实验验证。分子对接显示天然抗菌肽 Protegrin-2 与 Mpro 变构位点具有较高结合...
Cyclopropane-Containing Specialized Metabolites from the Marine Cyanobacterium cf.
海洋蓝藻在藻华期间可产生结构多样的生物活性次级代谢物，这些化感物质赋予微藻对抗竞争微生物和草食动物的化学防御能力。本研究从一株海洋蓝藻 cf. Lyngbya sp. 中分离并纯化得到少量含环丙烷的新化合物 benderadiene（2）以及已知脂质酸 lyngbyoic acid（1），并通过光谱方法完成结构表征。利用基于铜绿假单...
Study of the Sensing Kinetics of G Protein-Coupled Estrogen Receptor Sensors for Common Estrogens and Estrogen Analogs.
内源和外源雌激素广泛存在于食品及食品包装中，天然雌激素过量及合成雌激素滥用或非法使用可引发内分泌紊乱甚至癌症，因此准确评估具有雌激素样效应的食品功能成分或毒素具有重要意义。本研究通过自组装方法构建了基于 G 蛋白偶联雌激素受体（GPER）的电化学生物传感器，并以双层金纳米颗粒（AuNPs）修饰，用于测定五种 GPER 配体的传感动力...
Elucidation of DNA-Eltrombopag Binding: Electrochemical, Spectroscopic and Molecular Docking Techniques.
艾曲泊帕（eltrombopag, ELT）是一种强效辅助抗肿瘤药物，用于骨髓增生异常综合征（MS）和急性髓系白血病（AML）治疗。本研究通过伏安法、光谱技术和粘度测量研究 ELT 与 DNA 的相互作用机制。作者利用还原氧化石墨烯（rGO）修饰玻碳电极（GCE）构建了 DNA 生物传感器和纳米生物传感器，用于检测 DNA-ELT ...
Elucidating the interaction of antidepressant drug paroxetine with ct-dsDNA: A comparative study by electrochemical, spectroscopic, and molecular docking approaches.
本研究旨在通过电化学、荧光光谱和分子对接方法，考察苯基哌啶类抗抑郁药帕罗西汀（paroxetine, PARO）与生物大分子的相互作用。作者以双链牛胸腺DNA（ct-dsDNA）为模型生物分子，利用差分脉冲伏安法（DPV）监测ct-dsDNA中脱氧鸟苷阳极氧化信号的变化，研究PARO与ct-dsDNA的结合行为。荧光光谱实验在四种温...