基于变构转录因子（aTF）的生物传感器可用于检测代谢物和工业分子，但现有方法多依赖有限的天然 aTF，因此改变其配体特异性以识别新效应物具有重要意义。本研究以 Streptomyces coelicolor 的 PcaV 阻遏蛋白（MarR 家族 aTF）为基础，构建了检测羟基取代苯甲酸（包括原儿茶酸 PCA）的遗传编码生物传感器，...
假单胞菌 XylS 转录激活因子在苯甲酸类效应物存在下诱导 Pm 启动子转录，间甲苯酸最有效，对甲苯酸较弱。为改变其效应物特异性，作者在 E. coli 中建立双选择系统：Pm 启动子控制 bla 和 tetR，tet 启动子控制 cat。氨苄青霉素抗性用于正选择，富集识别目标配体的 XylS 突变体；氯霉素敏感性用于负选择，排除识...
随着生物基产业受到关注，快速有效改良菌株的技术需求显著增加。进化工程对生物学信息依赖较低，已被用于菌株改良。近年来，合成生物学在进化工程中取得重要进展，尤其发展了用于表型扰动的合成工具；同时，发现具有调控功能的生物部件并设计新型遗传回路，也推动了高通量筛选与选择。本综述首先简述用于诱变和筛选改良变体的合成生物学工具基础，随后描述这些...
合成甲基营养是指改造大肠杆菌等微生物使其以甲醇为碳源生长，是代谢工程与合成生物学的长期目标。NAD 依赖型甲醇脱氢酶（Mdh）是多数甲醇同化途径中的第一个酶，其较差的动力学性质限制途径通量，是合成甲基营养的主要瓶颈。为突破该瓶颈，作者利用甲醛生物传感器建立了噬菌体辅助非连续进化（PANCE）选择系统，用于筛选 Bacillus me...
单分子蛋白质测序的核心挑战之一，是对肽链中特定氨基酸进行高保真顺序识别与检测。N端规则通路适配蛋白ClpS可天然识别肽链N端氨基酸（NAA），野生型对N端Phe具有较高特异性但亲和力有限，同时也能识别Trp、Tyr和Leu。本研究采用定向进化方法，筛选对Phe和Trp具有更高亲和力与选择性的ClpS变体。以根癌农杆菌ClpS2为骨架...