14 条结果 关键词:滚环扩增 ×

Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor.

Lab on a chip 2021 Janik M, Hamidi SV, Koba M, Perreault J 等 7 人

滚环扩增(RCA)是聚合酶链式反应(PCR)的重要替代方案,尤其适用于需要快速、灵敏、可靠检测大量样本的疫情场景。本文首次报道利用光纤中飞秒激光加工形成的微腔内联马赫-曾德尔干涉仪(µIMZI),对等温 DNA 扩增进行直接、实时、无标记监测。该方案可在皮升级样品体积内完成光学分析。生物传感器的选择性由固定在微腔表面的 DNA 引物...

Highly sensitive detection of

RSC advances 2020 Yang K, Yu W, Huang G, Zhou J 等 6 人

金黄色葡萄球菌是医院感染和食源性疾病常见病原菌,亟需高灵敏检测方法。本文报道一种基于金纳米颗粒(AuNPs)和滚环扩增(RCA)的太赫兹(THz)超材料生物传感器,用于高灵敏检测金黄色葡萄球菌。RCA过程扩增金黄色葡萄球菌DNA片段,产生大量长单链DNA分子;这些分子与AuNPs偶联形成复合物,使样品折射率显著升高,从而增强超材料的...

Insights into the Formation of DNA-Magnetic Nanoparticle Hybrid Structures: Correlations between Morphological Characterization and Output from Magnetic Biosensor Measurements.

ACS sensors 2020 Oropesa-Nuñez R, Zardán Gómez de la Torre T, Stopfel H, Svedlindh P 等 6 人

理解探针功能化磁性纳米颗粒(MNPs)与 DNA 靶标或其扩增产物之间的结合机制,是优化用于 DNA 检测的磁性生物传感器的关键。本研究考察 DNA 功能化 MNPs 与滚环扩增产物(DNA-coils)杂交形成 DNA-MNP 杂交结构的分子相互作用。作者采用液相原子力显微镜(AFM)对杂交结构进行形貌表征,并利用磁性生物传感器测...

Integration of microbead DNA handling with optomagnetic detection in rolling circle amplification assays.

Mikrochimica acta 2019 Minero GAS, Cangiano V, Garbarino F, Fock J 等 5 人

滚环扩增(RCA)是一种线性等温核酸扩增技术,因垫锁探针识别具有高度特异性而广泛用于生物分子检测。磁性微珠(MMBs)可在多步检测中通过外部磁铁实现样品分离与转移,而光磁测量可通过磁性纳米颗粒(MNPs)的旋转扩散性质检测扩增产物,并可在任意透明样品容器中完成。本文提出两种将MMB样品处理与芯片上光磁检测整合到RCA检测中的策略。策...

Ultrasensitive Real-Time Rolling Circle Amplification Detection Enhanced by Nicking-Induced Tandem-Acting Polymerases.

Analytical chemistry 2019 Tian B, Fock J, Minero GAS, Garbarino F 等 5 人

基于锁探针连接(PLP)的滚环扩增(RCA)可区分单核苷酸变异,有望用于结核分枝杆菌(Mtb)等病原体耐药突变检测,但常规线性 RCA 的皮摩尔级检出限限制了临床应用。本文提出并验证了切割增强型 RCA(NickRCA)机制:限制性内切酶在环化模板上产生切口,使多个聚合酶在同一环模板上串联作用,释放单链扩增子单体。作者系统考察并控制...

Tunable superamphiphobic surfaces: a platform for naked-eye ATP detection.

Analytical and bioanalytical chemistry 2019 Huang F, Chen Y, Wang Y, Xia F

本文报道了一种由两种尺寸范围的TiO2纳米颗粒构成的可调超双疏表面。该表面通过将全氟辛基三乙氧基硅烷包覆的TiO2纳米颗粒乙醇悬浮液喷涂于玻璃片上简单制备。利用TiO2的光催化活性,通过梯度紫外照射诱导表面有机基团降解,可精细调控表面化学,获得具有梯度固体表面能或润湿性的超双疏表面。所制备表面表现出良好的液滴排序能力,能够区分不同浓...

On-Particle Rolling Circle Amplification-Based Core-Satellite Magnetic Superstructures for MicroRNA Detection.

ACS applied materials & interfaces 2018 Tian B, Qiu Z, Ma J, Donolato M 等 7 人

DNA组装的核心-卫星超结构因可调控的组成与功能,在药物递送、成像和生物传感中受到关注,其中卫星负载量决定对外界生物/物理刺激的信号响应强度。本文首次利用颗粒表面滚环扩增(on-particle RCA)快速制备具有高磁性纳米颗粒(MNP)负载的核心-卫星磁性超结构,并结合双链特异性核酸酶(DSN)辅助靶标循环,实现microRNA...

Terahertz spectroscopy for the isothermal detection of bacterial DNA by magnetic bead-based rolling circle amplification.

The Analyst 2017 Yang X, Yang K, Zhao X, Lin Z 等 9 人

由于快速灵敏细菌检测需求不断增加,本研究开发了一种基于滚环扩增(RCA)的太赫兹(THz)生物传感器,用于细菌 DNA 的等温检测。合成的细菌特异性 16S rDNA 序列与锁探针(PLP)杂交,PLP 的 5′ 和 3′ 端含有与目标序列完全互补的序列;识别目标后,线性 PLP 经连接酶连接形成环状 PLP。随后,固定在磁珠(MB...

RCA-Based Biosensor for Electrical and Colorimetric Detection of Pathogen DNA.

Nanoscale research letters 2016 Jeong J, Kim H, Lee DJ, Jung BJ 等 5 人

为疾病诊断与防控,已发展多种病原体检测策略。本研究构建了一种基于滚环扩增(RCA)的生物传感器,可在同一系统中以电学和比色两种模式检测病原体 DNA。该体系利用模板 DNA 与目标 DNA 杂交后由 T4 DNA 连接酶连接形成闭合环状 DNA;仅当目标 DNA 存在时,环状模板才能被 phi29 DNA 聚合酶持续复制。硫醇化引物...

Enzymatic Polymerization on DNA Modified Gold Nanowire for Label-Free Detection of Pathogen DNA.

International journal of molecular sciences 2015 Jeong J, Kim H, Lee JB

本文报道了一种用于检测单链病原DNA的无标记生物传感器。该传感器利用金纳米线(AuNW)与接枝在AuNW表面的引物DNA之间发生的目标增强凝胶化实现检测。目标DNA能够与线性DNA模板两端互补,使线性DNA环化;随后,固定在AuNW上的引物DNA通过滚环扩增(RCA)被连续延伸。在目标DNA存在时,延伸产生的长链DNA与作为支架纤维...

Turn-on optomagnetic bacterial DNA sequence detection using volume-amplified magnetic nanobeads.

Biosensors & bioelectronics 2015 Bejhed RS, de la Torre TZ, Donolato M, Hansen MF 等 6 人

本文报道了一种基于光磁读出和体积放大磁性纳米珠的霍乱弧菌DNA序列检测方法。该方法在垂直于光路的弱单轴交流磁场作用下,测量含有寡核苷酸标记磁性纳米珠和单链DNA大分子线圈的样品中激光透射强度的调制。目标DNA与锁式探针(padlock probe)两端互补配对并经连接酶连接成环,随后通过滚环扩增(RCA)形成长单链DNA线圈。目标存...

Real-space transmission electron microscopy investigations of attachment of functionalized magnetic nanoparticles to DNA-coils acting as a biosensor.

The journal of physical chemistry. B 2010 Akhtar S, Strömberg M, Zardán Gómez de la Torre T, Russell C 等 9 人

本文首次对功能化磁性纳米珠与DNA线圈之间的相互作用进行实空间表征。研究以滚环扩增(RCA)形成的DNA线圈为识别/放大元件,将氨基修饰的磁赤铁矿纳米珠(Nanomag-D NH2,40和130 nm)表面偶联硫醇化寡核苷酸探针,使其与DNA线圈互补序列杂交固定。作者结合复杂磁化测量与透射电子显微镜(TEM),统计每个DNA线圈上结...

Diffractometric detection of proteins using microbead-based rolling circle amplification.

Analytical chemistry 2010 Lee J, Icoz K, Roberts A, Ellington AD 等 5 人

本文报道一种无需荧光或放射性标记的自组装光学衍射生物传感器,利用滚环扩增(RCA)和磁性微珠实现信号放大。在镀金玻璃片上用PDMS印章微接触印刷15 μm宽交替链霉亲和素线条,固定生物素化捕获适配体,特异性捕获血小板衍生生长因子B链(PDGF-BB)。二级适配体-引物复合物结合目标蛋白后,垫锁探针杂交并经DNA连接酶环化,形成RCA...

Microscopic mechanisms influencing the volume amplified magnetic nanobead detection assay.

Biosensors & bioelectronics 2008 Strömberg M, Zardán Gómez de la Torre T, Göransson J, Gunnarsson K 等 7 人

本文研究体积放大磁性纳米珠检测法中珠尺寸、珠表面探针寡核苷酸覆盖度、珠浓度和滚环扩增(RCA)时间对检测机制的影响,以改进对该生物传感器微观机制的理解。该检测法将锁探针(padlock probe)靶标识别、RCA信号放大与布朗弛豫磁性纳米珠读出相结合。主要发现包括:(i)小尺寸磁性珠交叉连接多个RCA产物的倾向显著降低,因此可同时...