肺腺癌（LUAD）是癌症死亡主因之一。神经紧张素受体1（NTSR1）在LUAD中过表达并与不良预后相关，但治疗潜力未充分探索。本研究用多数据库生物信息学评估NTSR1表达、预后、遗传改变及免疫微环境关联，并以ONE-GO生物传感器、SPR、PRESTO-Tango和细胞内ELISA证实莲心碱（liensinine）特异性抑制NTSR...
基于变构转录因子（aTF）的生物传感器可用于为多种应用构建遗传电路。文献和在线数据库中包含数百个经实验验证的分子-转录因子配对，但相关知识分散且常不完整。此外，与生物体内可产生的化合物数量相比，已知存在TF-化合物相互作用的化合物比例很低。因此，需要新工具帮助研究者发现新的潜在TF-配体配对。本文提出Sensbio，一种计算工具，通...
肌酸（Cr）是一种广泛存在的非蛋白氨基酸，主要在肝脏、肾脏和胰腺中合成，并主要分布于高能量需求组织。肌酸通过钠/氯依赖性肌酸转运体（CRT）进入靶细胞，细胞内肌酸激酶（CK）催化镁-ATP与肌酸之间的可逆磷酸基团转移，生成磷酸肌酸（PCr）和镁-ADP。本文旨在利用公共数据库、数据仓库和生物信息学工具，对肌酸代谢的最新研究进行系统综...
热四膜虫是一种纤毛原生动物，可用作检测淡水重金属污染的全细胞生物传感器。本研究采用系统生物信息学方法，预测并分析热四膜虫中必需金属锌、铜以及非必需金属镉的金属蛋白组。通过整合蛋白质数据库中的金属结合结构域、金属结合模式及基因组注释信息，共鉴定出3784个潜在金属结合蛋白，显著多于UniProt中已注释的456个。研究进一步对这些新鉴...
抗体是重要的生物药物，但存在药代动力学不佳、免疫原性高和生产成本高等局限。高亲和力和高特异性的合成肽可作为抗体的替代，但目前缺乏指导此类肽设计的计算工具。本文提出一种基于表位-表位点相互作用（EPI）模式的计算设计方法。作者利用界面相互作用残基（I2R）方法，从蛋白质数据银行中的抗体-抗原复合物结构中提取参与分子相互作用的残基，并将...