Communications biology
2023
沙门氏菌和埃希氏菌是重要的模式生物、原核表达平台,其致病菌株也构成重大公共卫生威胁。为便于研究与生物技术应用,作者开发了一套阿拉伯糖诱导的人工转录因子(ATF)工具,利用 CRISPR/dCas9 和拟南芥来源的 DNA 结合蛋白,在埃希氏菌和沙门氏菌中于宽诱导剂浓度范围内调控基因表达。不同 ATF 的转录输出差异显著,尤其在改造阿...
ACS synthetic biology
2023
Torello Pianale L, Olsson L
本研究将用于实时监测酵母胞内环境的三步“构建—转化—评估”工具箱扩展并升级为双模块 ScEnSor(S. cerevisiae Engineering + Biosensor)试剂盒。生物传感器模块包含 8 种用于胞内环境的荧光报告系统,其中未折叠蛋白反应(UPR)、丙酮酸代谢和乙醇消耗 3 种为新加入,用以补充原有 5 种传感器。...
ACS synthetic biology
2023
Li C, Zhou Y, Zou Y, Jiang T 等 6 人
基于转录因子的生物传感器常用于代谢工程中基因表达的可诱导调控,以及高通量筛选和动态通路调控等相关应用。挖掘新型转录因子对于扩展这些工具集的可用性至关重要。本文报道了从解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)中鉴定、表征和工程化一种酚酸响应调控蛋白 PadR(BaPadR)。该 BaPadR 生物传感器系...
Synthetic and systems biotechnology
2023
Hu S, Zhang G, Jia X
本研究在假单胞菌 Pseudomonas putida KT2440 中构建了一种同时具有正反馈和负反馈级联放大器的镉离子(Cd2+)全细胞生物传感器 LTCM,并与此前仅含负反馈放大器的 TCM 进行比较。结果表明,LTCM 的线性响应范围由 0.05 μM 扩展至 0.1 μM,在相同培养条件下荧光输出信号提高 1.11–2.6...
ACS synthetic biology
2023
McSweeney MA, Zhang Y, Styczynski MP
RNA toehold switch是一类用于识别特定RNA触发序列的分子工具,但现有设计与表征尚不能明确其能否有效响应短于36 nt的触发序列。本文探索标准toehold switch使用23 nt截短触发序列的可行性,并评估具有显著同源性不同触发序列之间的串扰。研究发现,触发序列中存在高度敏感区域,仅一个碱基突变即可使开关激活降...
ACS synthetic biology
2023
Kutraite I, Malys N
没食子酸是常见植物次生代谢物,具有强自由基清除、细胞毒性、抗炎和抗菌活性。传统上通过单宁酸酸水解生产,成本高且环境危害大。为开发更可持续的微生物生物合成策略,本研究表征了 Pseudomonas putida KT2440 中基于转录因子的诱导系统 PpGalR/PPP_RS13150,该系统可剂量依赖地响应胞外没食子酸。研究发现,...