Journal of biological engineering
2025
细胞转运系统决定胞内分子浓度，可用于调节基于转录因子（TF）的生物传感器响应性。外排泵促进小分子外排，其活性会影响生物传感器检测准确性。本研究工程化细胞外排机制，以提高 DmpR 生物传感器响应性并降低串扰；该传感器利用酚响应型 TF DmpR 检测胞内酚类配体，但受细胞间配体扩散影响。通过敲除外排泵基因减少配体扩散并提高信号保真度...
ACS synthetic biology
2023
Kim J, Lu LC, Gao X, Hofmockel KS 等 6 人
为研究土壤微生物群落在难以成像环境材料中的群落尺度表型，作者评估了模型土壤群落（MSC）中单一成员能否在不破坏基质的情况下被编程报告基因表达。该 MSC 包含 Dyadobacter fermentans、Ensifer adhaerens、Rhodococcus sp003130705、Streptomyces sp0019056...
ACS synthetic biology
2015
Didovyk A, Kanakov OI, Ivanchenko MV, Hasty J 等 6 人
本文提出一种由遗传工程微生物细胞群体构成的分布式分类器概念设计。其核心思想是用大量弱分类器或简单分类器组成复杂分类器：构建具有随机化合成生物传感器电路的主细胞群体，使其对作为输入向量的化学信号具有宽范围敏感性。随机敏感性通过在前端元件中引入随机控制序列（如核糖体结合位点，RBS）构建合成基因电路库实现。训练过程通过依次呈现正、负输入...