4 条结果 关键词:虚拟筛选 ×

Molecular simulation-based 3D structural construction of olfactory receptor with agonist binding.

Journal of computer-aided molecular design 2025 Hirao T, Ihara Y, Ijichi C, Kudo G 等 6 人

嗅觉受体(ORs)是A类G蛋白偶联受体(GPCRs)中最大的亚家族,但已解析的三维结构很少。为有效发现新型气味分子并阐明其结合模式及激活/失活机制,需要基于结构的虚拟筛选和更深入的构象认识。本文提出一种结合AlphaFold2、分子模拟和虚拟筛选的协议,用于构建目标嗅觉受体OR9Q2与激动剂结合时的激活态模型。研究定义了配体稳定持续...

综述或非传感器论文 嗅觉受体OR9Q2AlphaFold2分子动力学

Recent advances in computational methods for biosensor design.

Biotechnology and bioengineering 2021 Khoshbin Z, Housaindokht MR, Izadyar M, Bozorgmehr MR 等 5 人

生物传感器是广泛应用于医疗诊断、食品质量控制和环境监测的分析工具,其设计需要兼顾成本、效率与功能提升。实验方法在生物传感器开发中已取得重要进展,但酶、蛋白质、肽、抗体和适配体等识别元件仍存在稳定性、寿命、制备成本、样品基质干扰及温度/pH敏感性等不足。计算设计被提出为弥补实验局限的关键途径,需要可靠的生物传感器各段结构预测、稳定性分...

Unraveling the role of the transcriptional regulator VirS in low pH-induced responses of

The Journal of biological chemistry 2019 Singh S, Goswami N, Tyagi AK, Khare G

结核分枝杆菌在巨噬细胞内低 pH 环境中维持胞内 pH 稳态并阻断吞噬体-溶酶体融合,是其持续存活的关键。本文利用胞质 pH 遗传学荧光报告系统证明,AraC/XylS 型转录调控因子 VirS 对酸性应激下胞内 pH 维持及酸化巨噬细胞内生存至关重要。转录组分析显示,VirS 在低 pH 下调控代谢酶、细胞壁包膜蛋白、外排泵、离子...

Protein Surface Structural Recognition in Inactive Areas: A New Immobilization Strategy for Acetylcholinesterase.

Bioconjugate chemistry 2018 Diao J, Yu X, Ma L, Li Y 等 5 人

本研究报道了一种基于乙酰胆碱酯酶(AChE)分子结构设计其固定化方法的新策略,以提高固定化酶的灵敏度与稳定性。利用MOLCAD多通道功能确定AChE表面的固定化结合位点,并从ZINC数据库(约5万个小分子)中筛选出11个候选亲和配体,包括(+)-儿茶素、(-)-表儿茶素、(-)-没食子儿茶素、橙皮素、柚皮素、槲皮素、二氢杨梅素、(-...