嗅觉受体（ORs）是A类G蛋白偶联受体（GPCRs）中最大的亚家族，但已解析的三维结构很少。为有效发现新型气味分子并阐明其结合模式及激活/失活机制，需要基于结构的虚拟筛选和更深入的构象认识。本文提出一种结合AlphaFold2、分子模拟和虚拟筛选的协议，用于构建目标嗅觉受体OR9Q2与激动剂结合时的激活态模型。研究定义了配体稳定持续...
昆虫嗅觉受体由必需亚基 ORco 和可变亚基 ORx 组成，是异源配体门控阳离子通道；单独表达时 ORco 形成同源四聚体通道，可被 ORco 特异性配体激活。作者利用昆虫细胞表达系统作为功能平台，在体外表达蚊子嗅觉受体，鉴定出天然来源的小分子 ORco 通道拮抗剂。这些拮抗剂相对于假定的 ORco 激动剂结合位点呈正构或变构作用，...
生物传感器是广泛应用于医疗诊断、食品质量控制和环境监测的分析工具，其设计需要兼顾成本、效率与功能提升。实验方法在生物传感器开发中已取得重要进展，但酶、蛋白质、肽、抗体和适配体等识别元件仍存在稳定性、寿命、制备成本、样品基质干扰及温度/pH敏感性等不足。计算设计被提出为弥补实验局限的关键途径，需要可靠的生物传感器各段结构预测、稳定性分...
结核分枝杆菌在巨噬细胞内低 pH 环境中维持胞内 pH 稳态并阻断吞噬体-溶酶体融合，是其持续存活的关键。本文利用胞质 pH 遗传学荧光报告系统证明，AraC/XylS 型转录调控因子 VirS 对酸性应激下胞内 pH 维持及酸化巨噬细胞内生存至关重要。转录组分析显示，VirS 在低 pH 下调控代谢酶、细胞壁包膜蛋白、外排泵、离子...
糜蛋白酶（chymotrypsin）是一种与多种生物过程相关的蛋白酶，并显著参与胰腺疾病发生，因此其快速灵敏检测对早期诊断和相关药物发现具有重要意义。本文发展了一种基于分子对接的虚拟筛选（MDVS）策略，用于鉴定靶向糜蛋白酶的新型非肽生物传感器。新发现的探针20对糜蛋白酶相对于相似酶胰蛋白酶具有约45倍特异性，并在糜蛋白酶催化下产生...
TAS2R14是哮喘治疗的重要潜在靶点，发现其激动剂对哮喘治疗具有重要价值。本研究建立了一种结合虚拟筛选、基于新型TAS2R14功能化高电子迁移率晶体管（HEMT）生物传感器的亲和筛选以及UPLC-MS分析的策略，用于从桔梗（Platycodon grandiflorum）中筛选TAS2R14激动剂。基于配体的虚拟筛选得到16个最佳...
荧光假单胞菌（Pseudomonas fluorescens）是冷藏生乳和水产品腐败的主要革兰阴性嗜冷菌。群体感应（QS）通过自诱导物监测细菌密度并调控铁载体分泌、群游运动、生物膜形成等生理活动，因此寻找群体感应抑制剂（QSI）是控制食品腐败的潜在策略。本研究以中药数据库为来源，筛选低毒 QSI。通过全基因组测序获得 P. fluo...
本研究报道了一种基于乙酰胆碱酯酶（AChE）分子结构设计其固定化方法的新策略，以提高固定化酶的灵敏度与稳定性。利用MOLCAD多通道功能确定AChE表面的固定化结合位点，并从ZINC数据库（约5万个小分子）中筛选出11个候选亲和配体，包括(+)-儿茶素、(-)-表儿茶素、(-)-没食子儿茶素、橙皮素、柚皮素、槲皮素、二氢杨梅素、(-...