Multiple GO-SELEX for efficient screening of flexible aptamers.
本文报道一种简单、快速、高通量的小分子适配体筛选方法——简单多 GO-SELEX。该方法利用氧化石墨烯（GO）作为无固定靶标的筛选平台，先以反靶标去除随机单链 DNA 文库中的非特异性序列，再让 GO 吸附 ssDNA，随后加入 tebuconazole、inabenfide 和 mefenacet 三种农药混合物，使与靶标结合的适...
Ultrasensitive colorimetric carcinoembryonic antigen biosensor based on hyperbranched rolling circle amplification.
本研究开发了一种基于超支化滚环扩增（HRCA）的癌胚抗原（CEA）比色生物传感器，具有高灵敏度和特异性。CEA 适配体与其靶标 CEA 高亲和力结合形成复合物，使引入的 CDNA 不能与适配体杂交；游离 CDNA 可引发 HRCA 反应，产生大量单链 DNA（ss-DNA）。ss-DNA 易吸附于金纳米颗粒（AuNPs）表面，阻止盐...
Development of an indirect competitive assay-based aptasensor for highly sensitive detection of tetracycline residue in honey.
四环素（TC）因广谱抗菌活性和成本低被广泛用于动物疾病预防和控制，但滥用会严重影响人类健康并造成贸易损失，因此亟需开发高性能的TC检测技术。本研究开发了一种基于间接竞争酶联适配体检测（ic-ELAA）的生物传感器。通过系统进化配体指数富集（SELEX）筛选得到一条76碱基单链DNA（ssDNA）适配体，用于蜂蜜中TC的识别与检测。该...
A colorimetric aptamer biosensor based on cationic polymer and gold nanoparticles for the ultrasensitive detection of thrombin.
本文报道了一种基于阳离子聚合物和金纳米粒子（AuNPs）的比色适配体生物传感器，用于超灵敏检测凝血酶（thrombin）。该体系以未修饰的15 nm AuNPs为信号探针，以21-mer凝血酶结合适配体（TBA）为识别元件。在无凝血酶时，单链TBA呈随机卷曲构象，通过静电作用与阳离子聚合物聚二烯丙基二甲基氯化铵（PDDA）形成双链样...
The unfolding of G-quadruplexes and its adverse effect on DNA-gold nanoparticles-based sensing system.
本文通过监测 13 nm 金纳米颗粒（AuNPs）在 520 和 650 nm 处的局部表面等离子共振（LSPR）吸光度（A650/A520），研究了三种鸟嘌呤富集单链 DNA（TBA、PW17 和 PSO）在 Pb2+ 或 K+ 稳定 G-四链体溶液中向 AuNPs 的吸附行为。结果表明，在 Pb2+ 稳定 G-四链体（G-Pb2...
Target-induced self-assembly of DNA nanomachine on magnetic particle for multi-amplified biosensing of nucleic acid, protein, and cancer cell.
本文建立了一种用于等温多放大检测核酸及适配体底物的生物传感系统。该系统将缺口滚动环扩增（N-RCA）与信标辅助扩增（BAA）相结合，并以 DNA 酶作为报告单元，实现高灵敏比色检测。对于 DNA 分析，目标 DNA 首先识别并捕获核酸功能化磁性微球，随后另外两条核酸在磁球表面自组装形成多组分 DNA 超分子结构。经磁分离后，T4 D...
Simultaneous improvement of specificity and affinity of aptamers against Streptococcus mutans by in silico maturation for biosensor development.
计算机进化与体外系统相结合可促进高特异性、高亲和力功能适配体的开发。虽然系统性指数富集（SELEX）是筛选适配体的常用方法，但有时难以获得结合性能足够理想的序列。作者此前开发了基于遗传算法的在硅成熟（ISM），通过智能利用定义序列空间内的随机搜索来优化适配体序列并改善目标功能。本文展示了 ISM 在同时提高适配体对变形链球菌（Str...
An indirect competitive assay-based aptasensor for detection of oxytetracycline in milk.
土霉素（oxytetracycline, OTC）是用于控制动物疾病的常用抗菌药物，其滥用可能危害人类健康。本研究开发了一种基于单链 DNA（ssDNA）适配体的生物传感器，用于检测 OTC。通过系统进化指数富集配体（SELEX）筛选 OTC 结合探针适配体，并用酶联适配体检测（ELAA）鉴定其结合特性。在筛选得到的 5 个适配体中...