本研究通过融合妥布霉素适配体与曼氏血吸虫锤头核酶（HHR），构建了妥布霉素浓度依赖型全细胞微生物传感器（tob-HHAz）。该传感器将各模块整合为一条完整 RNA 序列，可易于导入大肠杆菌，且不易受严苛外界环境影响。通过体内高通量筛选鉴定出三个独立的妥布霉素敏感 RNA 结构，并在体外验证其发生预期自切割反应。利用 RNA 二级结构...
合成生物学在人类健康、工业生物生产和生态系统监测中的应用通常需要小分子传感能力，常以遗传编码小分子生物传感器形式实现。为快速开发面向广泛小分子靶标的传感器，本研究利用此前建立的DRIVER方法，对代表高通量药物筛选的密集多路小分子混合物进行RNA生物传感器选择。作者从大型多样性药物筛选库中随机选取5120个靶标化合物，完成95轮选择...
基于RNA的胞内代谢物传感器是应对代谢异质性的有前景工具，但将体外筛选适配体转化为体内功能性传感器仍具挑战。本文针对糖酵解通量信号代谢物果糖-1,6-二磷酸（FBP），通过SELEX筛选获得FBP结合RNA适配体C45，并将其与锤头核酶（HHRz）执行域融合，构建多种RNA装置库。利用酿酒酵母中FACS高通量分选、下一代测序以及遗传...
小分子代谢物通过信号通路调控多种细胞过程，但常以低浓度存在，使其信号网络研究困难。本文预览了 You 等提出的 RNA 整合器（RNA integrators），一种模块化、纯 RNA 编码的荧光生物传感器，用于在活细胞中实时测量低丰度代谢物。传统蛋白 FRET 传感器受限于特异性结合域开发，核糖开关受限于荧光蛋白翻译成熟时间，Sp...
具有靶标RNA切割活性的短RNA序列在细胞基因调控和生物传感器研究中具有前景，但不同于水溶液的反应介质可能引起意想不到的分子相互作用和性质。本研究利用水溶性中性共溶剂，考察了由空间拥挤和溶剂性质改变引起的分子拥挤效应对锤头核酶活性的影响。在10 mM MgCl2下，20 wt%的聚乙二醇（PEG）及其他共溶剂使RNA水解速率提高2....
尽管金属离子对DNA和RNA折叠至关重要，但关于分子环境如何影响金属离子结合的报道有限。本研究以聚乙二醇（PEG）作为共溶剂改变反应溶剂性质，考察了锤头核酶对Mg2+和Na+的结合特性。平均分子量为8000的PEG8000在较低Mg2+浓度下提高了反应速率，但在较高Mg2+浓度下无明显加速。进一步发现，PEG8000并不改变所结合的...