The journal of physical chemistry. B
2019
Junker NO, Vaghefikia F, Albarghash A, Höfig H 等 11 人
分子拥挤对生物大分子结构与动力学性质的影响不仅取决于拥挤剂浓度,还取决于拥挤剂的分子量和结构紧密程度。本文采用荧光相关光谱(FCS)研究了分子量从17 kDa到2.7 MDa的多种生物大分子在模拟拥挤环境中的平移迁移性。实验在缓冲液中使用不同分子量的聚乙二醇(PEG)和Ficoll聚合物作为拥挤剂,分析生物示踪分子扩散系数随拥挤剂体...
Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
2014
Sulmann S, Dell'Orco D, Marino V, Behnen P 等 5 人
信号通路中的关键蛋白通过构象开关控制信号转导的启动、持续与终止。钙离子(Ca2+)传感器蛋白是典型开关蛋白,可响应胞内 Ca2+ 浓度振荡而发生构象变化。本文利用动态光散射(DLS)和基于表面等离子共振(SPR)的新方法,比较了钙调蛋白(CaM)、肌钙蛋白 C(TnC)、recoverin 和鸟苷酸环化酶激活蛋白(GCAP1)等典型...
Analytical chemistry
2012
Dell'Orco D, Sulmann S, Linse S, Koch KW
钙离子传感蛋白通过响应胞内钙离子浓度的精细变化而采取特定构象,从而调控多种细胞过程。本文报道了一种基于表面等离子共振(SPR)的方法,可在 0.1−0.6 μM 钙离子浓度范围内同时检测四种参与脊椎动物光转导级联的钙离子传感蛋白(钙调蛋白、recoverin、GCAP1 和 GCAP2)的构象动力学。在定量模拟细胞条件的体系中,该方...
Journal of the American Chemical Society
2009
Nakano S, Karimata HT, Kitagawa Y, Sugimoto N
具有靶标RNA切割活性的短RNA序列在细胞基因调控和生物传感器研究中具有前景,但不同于水溶液的反应介质可能引起意想不到的分子相互作用和性质。本研究利用水溶性中性共溶剂,考察了由空间拥挤和溶剂性质改变引起的分子拥挤效应对锤头核酶活性的影响。在10 mM MgCl2下,20 wt%的聚乙二醇(PEG)及其他共溶剂使RNA水解速率提高2....
Nucleic acids symposium series (2004)
2008
Nakano S, Kitagawa Y, Karimata HT, Sugimoto N
尽管金属离子对DNA和RNA折叠至关重要,但关于分子环境如何影响金属离子结合的报道有限。本研究以聚乙二醇(PEG)作为共溶剂改变反应溶剂性质,考察了锤头核酶对Mg2+和Na+的结合特性。平均分子量为8000的PEG8000在较低Mg2+浓度下提高了反应速率,但在较高Mg2+浓度下无明显加速。进一步发现,PEG8000并不改变所结合的...