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Imino proton NMR guides the reprogramming of A•T specific minor groove binders for mixed base pair recognition.

Nucleic acids research 2016 Harika NK, Paul A, Stroeva E, Chai Y 等 7 人

DNA 序列特异性结合对于靶向转录因子-DNA 复合物以调控基因表达至关重要。杂环双胍化合物 DB2277 可特异性识别 AAAGTTT 型混合碱基序列小沟中的单个 G•C 碱基对。核磁共振(NMR)光谱显示结合态化合物存在主要和次要两种物种。为理解决定混合 DNA 序列中结合亲和力与取向的原理,作者用 NMR 和热熔实验考察了三十...

Understanding mixed sequence DNA recognition by novel designed compounds: the kinetic and thermodynamic behavior of azabenzimidazole diamidines.

Biochemistry 2015 Paul A, Chai Y, Boykin DW, Wilson WD

小分子有机化合物对 DNA 的序列特异性识别为外部调控基因表达提供了潜在有效途径,也是细胞生物化学的重要目标。基于已知模块的理性设计可能获得与特定 DNA 序列强而选择性结合的化合物。一种初步策略是从常见的 A·T 碱基对识别分子出发,引入 G·C 识别单元。本文报道了一种合成化合物与 DNA 的相互作用,该化合物利用氮杂苯并咪唑基...