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Fluorogenic RNA-Based Biosensor to Sense the Glycolytic Flux in Mammalian Cells.

ACS chemical biology 2022 Geraci I, Autour A, Pietruschka G, Shiian A 等 8 人

实时监测代谢通量需要能将代谢物浓度变化转换为可读信号的传感分子。荧光RNA生物传感器因仅在结合目标分子时发光而具有应用前景,但此前尚缺乏可直接观察哺乳动物细胞内关键代谢物的此类工具。作者以体外筛选获得的果糖-1,6-二磷酸(FBP)结合RNA适配体C45和可结合DFHBI的荧光RNA Baby Spinach为基础,构建嵌合RNA文...

Guanidine Biosensors Enable Comparison of Cellular Turn-on Kinetics of Riboswitch-Based Biosensor and Reporter.

ACS synthetic biology 2021 Manna S, Truong J, Hammond MC

细胞传感器在合成生物学、代谢工程和诊断中具有重要价值,但针对同一配体系统比较核糖开关型生物传感器与报告基因开启动力学的研究尚缺乏。本研究开发了用于检测胍(guanidine)的RNA荧光生物传感器(RBF biosensors)。胍是常见变性剂,也是肥料和爆炸物化合物的前体;其可透膜且在大肠杆菌中毫摩尔浓度下无毒,因此可直接向细胞添...

荧光生物传感器 核糖开关Spinach2DFHBI

RNA-based fluorescent biosensors for live cell detection of bacterial sRNA.

Biopolymers 2021 Kitto RZ, Christiansen KE, Hammond MC

细菌含有多种 RNA,用于在环境刺激下紧密调控基因表达。细菌小 RNA(sRNA)与蛋白辅因子协同结合互补 mRNA,从而上调或下调蛋白合成。sRNA 的活体成像有助于实时理解其时空动态,并为合成生物学和治疗应用提供新策略。目前 sRNA 成像方法在体内应用有限,无法提供 sRNA 水平波动的实时信息。本文报道了一种用于细菌 sRN...

A genetically encoded fluorescent biosensor for detecting nitroreductase activity in living cancer cells.

Analytica chimica acta 2019 Xu F, Fan M, Kang S, Duan X

基因编码荧光生物传感器能够在复杂细胞环境中原位监测生化过程,具有易于导入细胞、组织和生物体并支持长期成像的优势。RNA 模拟绿色荧光蛋白(RNA mimics of GFP)是由 RNA 适配体与小分子荧光团形成的复合物,其荧光亮度可与荧光蛋白相当;荧光团在未结合特定 RNA 时不发光。本研究设计并开发了一种基于 RNA mimic...

A conformational switch-based fluorescent biosensor for homogeneous detection of telomerase activity.

Talanta 2019 Zhou Y, Shen S, Lau C, Lu J

端粒酶活性是重要的肿瘤生物标志物,其检测对癌症诊断和治疗具有重要意义。本文报道了一种基于构象开关的均相荧光生物传感器,用于检测端粒酶活性。作者对 RNA 适配体 Spinach 进行重新设计,在其 5′端扩展并使其折叠为失活构象,从而阻止与小分子荧光团 5-difluoro-4-hydroxybenzylidene imidazol...

Designing fluorescent biosensors using circular permutations of riboswitches.

Methods (San Diego, Calif.) 2018 Truong J, Hsieh YF, Truong L, Jia G 等 5 人

基于RNA的荧光生物传感器(RBF)通过将天然核糖开关的配体识别域与体外筛选的荧光适配体融合,用于在体外和活细胞中检测多种代谢物。已有设计采用不同拓扑结构以适应核糖开关结构多样性。本文以SAM-I核糖开关为模型,证明对核糖开关配体识别域进行环状置换(circular permutation)后,仍可构建具有功能的RNA荧光生物传感器...

荧光生物传感器 核糖开关SAMSpinach2DFHBI