Scientific reports
2019
Jara M, Maes I, Imamura H, Domagalska MA 等 6 人
在应激条件下,部分微生物会进入可逆的静止期,表现为不增殖或缓慢增殖,从而维持存活。这种适应现象近年才在利什曼原虫中被发现。本研究建立了一种体外模型和一种生物传感器,用于在群体和单细胞水平追踪利什曼原虫的静止状态。该生物传感器是将绿色荧光蛋白(GFP)报告基因整合到 18S 核糖体 DNA(rDNA)位点,通过监测 18S rRNA ...
ACS synthetic biology
2019
Chen SY, Wei W, Yin BC, Tong Y 等 6 人
全细胞生物传感器因稳健、环保且成本低而受到关注,但多数传感器使用天然野生型启动子,常存在背景噪声高、灵敏度低的问题。本研究通过设计启动子的核心元件,即RNA聚合酶结合位点和转录因子结合位点,提高全细胞生物传感器电路的信噪比。以概念验证为目的,作者对大肠杆菌K-12基因组中的亚砷酸盐调控启动子进行改造,通过平衡ArsR结合位点(ABS...
Synthetic and systems biotechnology
2019
Singh K, Ainala SK, Kim Y, Park S
乳酸存在D(−)-和L(+)-两种立体异构体,二者均为可降解塑料聚乳酸的重要单体。本研究在荧光假单胞菌A506中鉴定并部分表征了一种新型D-乳酸诱导系统,并将其开发为生物传感器。D-乳酸分解代谢操纵子lldP-dld-II受反向转录的D-lldR基因负调控,D-lldR编码GntR型转录调控蛋白;加入D-乳酸后阻遏被解除。该解除作用...
Applied and environmental microbiology
2019
Hernandez MN, Lindow SE
表生菌Pseudomonas syringae B728a产生具有吸湿性的生物表面活性剂syringafactin。其吸水潜力较高:在高相对湿度下可吸收自身重量250%的水,但在较低相对湿度下吸湿性明显降低,提示该物质对产生细胞的益处强烈依赖环境。作者利用表达GFP的水胁迫激活proU启动子生物传感器菌株,评估syringafact...
Sensors (Basel, Switzerland)
2019
Vlach M, Quesnot N, Dubois-Pot-Schneider H, Ribault C 等 11 人
人肝癌 HepaRG 细胞表达多数药物代谢酶,是原代人肝细胞培养替代模型,可用于药物代谢与外源物毒性评价。本研究利用慢病毒载体将细胞色素 P450(CYP)1A1/2、2B6 和 3A4 基因的部分启动子序列克隆至 pLV-GFP 报告载体上游,建立稳定表达绿色荧光蛋白(GFP)的转基因 HepaRG 全细胞生物传感器。结果显示,C...
Biotechnology letters
2019
Bai D, Ding D, Li J, Cong L 等 5 人
本研究旨在通过理性突变分析、生物传感器与计算机辅助模拟相结合,确定大肠杆菌 TyrR 蛋白中 L-苯丙氨酸(L-Phe)的结合位点。TyrR 是芳香族氨基酸合成与转运相关基因的主要转录调控因子,其配体结合位点的鉴定是蛋白功能注释和基于结构的蛋白设计的重要基础。作者构建了以 tyrP 启动子驱动绿色荧光蛋白(GFP)表达、并携带 Ty...
ACS synthetic biology
2019
Li L, Tu R, Song G, Cheng J 等 8 人
针对目标代谢物的生物传感器可为代谢工程提供高通量筛选工具,但已充分表征的代谢物感知模块往往缺乏,限制了稳健生物传感器的快速开发。本研究提出转录组辅助代谢物感知(TAMES)策略,通过比较目标代谢物产生株与非产生株的选择性转录组分析,并结合定量逆转录 PCR(RT-qPCR)验证,筛选响应目标代谢物的感知模块。将该策略应用于 3-脱氢...