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Development of a GFP biosensor reporter for the unfolded protein response-signaling pathway in plants: incorporation of the bZIP60 intron into the GFP gene.

Plant signaling & behavior 2022 Carrillo R, Christopher DA

测量植物未折叠蛋白反应(UPR)激活状态对理解胁迫适应很重要。作者开发了一种活细胞 UPR 生物传感器-报告系统:将 bZIP60 位点的小细胞质剪接内含子整合到 GFP 基因 5′ 端,构建 35S::bZIP60 intron:GFP 载体。该载体在拟南芥原生质体中瞬时表达时,非 UPR 条件下内含子阻止 GFP mRNA 翻译...

Isolation of novel quorum-sensing active bacteria from microbial mats in Shark Bay Australia.

FEMS microbiology ecology 2019 Charlesworth JC, Watters C, Wong HL, Visscher PT 等 5 人

群体感应是使局部微生物群落表型协调的遗传调控系统。本研究采用靶向方法解析澳大利亚Shark Bay微生物席中的群体感应系统,既对整体微生物席提取物进行分析,又建立分离菌株库。作者从不同席型中分离得到165株细菌,并使用AHL生物传感器E. coli MT102进行筛选。基于序列同一性,30株独特分离株属于变形菌门、放线菌门和厚壁菌门...

Identification of promoter P

Toxicology and industrial health 2018 Prabhakaran R, Rajkumar SN, Ramprasath T, Selvam GS

铜绿假单胞菌中镉的修复主要依赖 cadA 和 cadR 基因,分别编码 P 型 ATPase CadA 和转录调控蛋白 CadR。尽管已有研究涉及这些金属感知与调控蛋白,但其启动子、金属感知及结合能力仍不清楚。本研究旨在表征 CadR、鉴定 PcadR 启动子,并用生物信息学分析蛋白–启动子–金属结合亲和力,同时在 E. coli ...

全细胞生物传感器 PcadR启动子CadRGFP报告系统

Metagenomic scaffolds enable combinatorial lignin transformation.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2014 Strachan CR, Singh R, VanInsberghe D, Ievdokymenko K 等 8 人

工程化微生物转化木质纤维素生物质对发展现代生物炼制、降低对石油基能源和化学品的依赖至关重要。当前许多生物过程依赖大肠杆菌的遗传可操作性,重点在于纤维素/半纤维素降解、小分子生产和产物抑制耐受;而木质素转化过程仍处起步阶段,涉及的环境菌株和酶较少。本文开发了一种响应单芳烃木质素转化产物、适用于大肠杆菌功能筛选的生物传感器。利用该传感器...

AutomiG, a biosensor to detect alterations in miRNA biogenesis and in small RNA silencing guided by perfect target complementarity.

PloS one 2013 Carré C, Jacquier C, Bougé AL, de Chaumont F 等 13 人

miRNA 生物发生或活性缺陷与发育异常和多种疾病相关。在果蝇中,miRNA 主要装载到 Argonaute-1(Ago1),引导靶 RNA 沉默;同时 miRNA 通路也与 RNA 干扰(RNAi)通路重叠,部分 miRNA 可结合 RNAi 效应因子 Argonaute-2(Ago2)。作者构建了一个基因构建体,由单一诱导型启动...

Direct and indirect use of GFP whole cell biosensors for the assessment of bioprocess performances: design of milliliter scale-down bioreactors.

Biotechnology progress 2013 Brognaux A, Thonart P, Delvigne F, Neubauer P 等 7 人

本研究利用响应底物限制的微生物全细胞生物传感器开发了一种可用作缩小规模(scale-down)工具的微型生物反应器平台。在大肠杆菌中选择了三种绿色荧光蛋白(GFP)转录报告系统:uspA::gfp、csiE::gfp 和 yciG::gfp。前期研究表明,这类启动子可在底物限制条件下被诱导,而在异质性生物反应器培养中受到显著抑制;本...