Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
2022
Marukhlenko AV, Morozova MA, Mbarga AMJ, Antipova NV 等 7 人
金属螯合是改善药物理化性质和治疗潜力的常用策略。本文展示基于拓扑描述符的简单定量构效关系（QSAR）方法可用于研究锌与生物源氨基酸形成的螯合物。作者预测，当两个氨基酸分子分别通过羧基氧和氨基氮与中心锌离子配位并形成双环结构时，锌氨基酸复合物 Zn(AA)2 的拓扑 Balaban 指数 J 与其脂溶性 logP 之间存在结构—性质关...
Frontiers in bioengineering and biotechnology
2017
Sagawa T, Mashiko R, Yokota Y, Naruse Y 等 6 人
由于细菌趋化信号转导相对简单，大肠杆菌 Tar 和 Tsr 双跨膜趋化受体长期被视为生物传感器候选模型。以往研究主要采用 L-天冬氨酸和 L-丝氨酸作为典型配体，但 Tar 和 Tsr 还能识别多种类似物，其识别机制尚不清楚。为提取不同类似物识别的共同特征，作者对 38 个已知吸引物和 15 个非吸引物进行 PM6 量子化学计算，获...
Journal of medicinal chemistry
2009
Nilsson M, Hämäläinen M, Ivarsson M, Gottfries J 等 8 人
本研究设计并合成了一组靶向凝血酶 S2–S3 口袋的小分子化合物，其中部分化合物不与 S1 口袋发生相互作用。作者以脯氨酸作为常见 P2 骨架，结合已知 P3 残基以及不同大小和脂溶性的 P1 取代基，构建定向化合物库。采用表面等离子共振（SPR）生物传感器技术测定化合物与凝血酶的结合常数，结果与传统酶学实验所得 IC50 值良好一...