Talanta
2020
John Ho LS, Fogel R, Limson JL
组胺是生物医学和食品质量控制中的重要标志物,现有荧光、电化学和酶学方法存在缺陷,难以常规检测。本研究通过指数富集系统进化(SELEX)筛选出靶向组胺的单链DNA适配体,并借助生物信息学分析候选序列。采用磁珠酶联寡核苷酸法(ELONA)测定适配体对固定化组胺的表观结合亲和力,随后在生理pH下用电化学阻抗谱(EIS)检测未修饰组胺。适配...
ACS applied bio materials
2019
Eissa S, Siddiqua A, Chinnappan R, Zourob M
适配体因高亲和性和特异性成为重要生物识别受体,但传统SELEX选择过程繁琐、昂贵且耗时,限制其广泛应用。本文设计了一种电化学SELEX平台,用于快速、高效、低成本地富集和识别小分子适配体。该平台将目标分析物共价固定于金电极表面,提高选择效率,并可通过方波伏安法原位监测富集DNA。与传统SELEX相比,该方法避免使用固相微珠和荧光标记...
Journal of the American Chemical Society
2019
Smestad J, Wilbanks B, Maher LJ
组合化学通过随机文库扩增筛选出能结合靶分子的适配体,但适配体穿过细胞膜并进入特定亚细胞区室仍是化学生物学难题。本文提出一种体外筛选策略,利用DNA连接酶奖励型生物传感器从约10^14多样性的随机DNA文库中筛选可自主归巢至培养细胞细胞核的裸DNA适配体。该传感器由随机DNA文库、5′-磷酸化诱饵寡核苷酸和支架寡核苷酸杂交形成,缺口位...
ACS synthetic biology
2019
Jang S, Jang S, Im DK, Kang TJ 等 6 人
己内酰胺是合成尼龙-6的单体,近期已开发用于生物基生产尼龙-6的重组微生物菌株。胞内己内酰胺生物传感器可促进重组微生物菌株的高通量代谢工程。由于重组菌株会混合生产己内酰胺和戊内酰胺,己内酰胺传感器必须对己内酰胺具有高特异性,但此前尚未报道高特异性己内酰胺传感器。本文开发了一种特异性响应己内酰胺的人工核糖开关。该核糖开关采用体外-体内...
Scientific reports
2019
Mehennaoui S, Poorahong S, Jimenez GC, Siaj M
本研究报道了一种用于检测地塞米松(DXN)的高亲和力适配体及其无标记电化学阻抗适配体传感器。作者采用指数富集系统进化(SELEX)技术,从1.08×10^15条随机单链DNA库中筛选出适配体DEX04,其解离常数KD为18.35 nM,并与DXN结合后发生明显构象变化,且对孕酮、诺孕酯和雌二醇等类似激素无交叉反应。随后将二硫键修饰的...
Molecules (Basel, Switzerland)
2019
Zhang Y, Lai BS, Juhas M
适配体是短单链 DNA、RNA 或合成 XNA 分子,可通过体外筛选获得,以高亲和力和高特异性识别几乎任何目标分子。它们已广泛用于基础研究发现、食品安全保障和环境监测,并在临床诊断和治疗中展现出应用前景。本综述更新该快速进展领域的最新进展,重点介绍适配体的生成方法及其在生物传感、生物技术和医学中的应用。文章还讨论了适配体在靶标特异性...
Biosensors & bioelectronics
2019
Díaz-Fernández A, Miranda-Castro R, de-Los-Santos-Álvarez N, Rodríguez EF 等 5 人
开发能够检测蛋白质特定糖基化模式的化学传感器,为癌症早期检测提供了有力手段。然而,由于识别蛋白所连糖链的受体难以发现,这一策略很少被探索。本文描述了一种简单方法,可将适配体选择导向糖蛋白的糖结构,并以前列腺特异性抗原(PSA)为模型靶标。利用该策略,我们鉴定到一个适配体(PSA-1),它以合理亲和力结合 PSA 的糖基部分(解离常数...
Talanta
2019
Bayat P, Taghdisi SM, Rafatpanah H, Abnous K 等 5 人
本研究通过系统进化指数富集(SELEX)技术筛选识别肿瘤细胞表面过表达分子 CD70 的单链 DNA 适配体。研究同时采用纯化 CD70 蛋白和表达 CD70 的细胞作为靶标,先进行 10 轮蛋白 SELEX,再进行 7 轮细胞 SELEX,最终获得对 CD70 具有高亲和力和高特异性的适配体 Apt928。实验表明,Apt928 ...
Chembiochem : a European journal of chemical biology
2019
Ma L, Liu J
钠是生物体系中最常见的金属离子之一,但基于DNA的钠探针直到近期才被报道。NaA43是一种仅由Na+激活的Na+特异性RNA切割DNAzyme。本研究以六氨合钴(III)(Co(NH3)63+)作为预期金属辅因子进行体外筛选,却获得NaA43的突变体NaH1,二者仅相差两个核苷酸。NaA43的最适pH为7.0,而NaH1的最适pH为...
Micromachines
2018
Mazaafrianto DN, Maeki M, Ishida A, Tani H 等 5 人
自系统性进化指数富集(SELEX)方法建立以来,适配体作为生物识别元件在传感检测中发挥了重要作用。微器件系统具有试剂消耗低、样品通量高、可一次性使用等优势,因此基于微流控的适配体传感器在分析检测中的应用需求不断增加。本综述首先介绍适配体传感器的基本概念,随后系统总结微器件适配体传感器在多种平台上的先进应用。文中涵盖微流控芯片、纸基微...
Molecules (Basel, Switzerland)
2018
Liu X, Lu Q, Chen S, Wang F 等 9 人
本文提出一种筛选克伦特罗(CBL)特异性适配体的多技术组合策略。以固定化单链DNA(ssDNA)文库为基础,采用指数富集系统进化(SELEX)筛选适配体,并用实时定量PCR(Q-PCR)监测富集进程;富集文库经高通量测序获得候选序列。随后利用金纳米粒子(AuNPs)比色生物传感器对候选适配体进行初步活性鉴定,并通过圆二色光谱(CD)...
Scientific reports
2018
Aljohani MM, Chinnappan R, Eissa S, Alsager OA 等 8 人
达比加群酯(dabigatran etexilate,PRADAXA)是一种新型口服抗凝药,广泛用于血栓性疾病、卒中及房颤患者全身栓塞的预防。虽然其抗凝效果安全有效,但治疗可能增加出血风险,而目前缺乏测定血液中该药物浓度的特异性实验室检测,尤其在创伤、药物中毒、急诊手术或不可控出血时成为重要障碍。本研究采用指数富集配体系统进化(SE...
ACS sensors
2018
Feagin TA, Maganzini N, Soh HT
能够结合目标后发生结构转换的适配体生物传感器为分子检测提供了有力策略。然而,将适配体改造为结构转换生物传感器的过程具有挑战性,常依赖试错,且缺乏成熟设计原则。本文作为传感器专题综述,系统考察了将结构转换功能引入现有适配体的多种设计策略,包括适配体信标、分裂适配体传感器和链置换传感器,并通过热力学分析突出影响其性能的关键变量。文章还介...
Journal of agricultural and food chemistry
2018
Gu H, Duan N, Xia Y, Hun X 等 6 人
本研究提出一种基于磁分离的多重系统进化指数富集(SELEX)策略,用于同时筛选针对三种海洋生物毒素——膝孔酸(DA)、石房蛤毒素(STX)和河豚毒素(TTX)的单链DNA适配体。作者制备了磁性还原氧化石墨烯(MRGO),利用其对未结合单链DNA的吸附作用简化分离步骤。经过前12轮混合目标筛选和随后4轮单目标筛选,对三个富集ssDNA...
Analytical biochemistry
2018
Bayraç AT, Donmez SI
肺炎球菌是全球感染性疾病的重要病原菌,尤其在儿童、老年人和免疫缺陷患者中危害严重,且抗生素耐药肺炎链球菌日益增多,因此需要简单、快速、特异的检测方法。本研究采用细菌系统进化指数富集(SELEX)技术,以活菌为靶标筛选出可特异性识别肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)的DNA适配体,并将其整合到氧化石墨烯(G...
Journal of visualized experiments : JoVE
2018
Wu X, Diao D, Lu Z, Han Y 等 6 人
邻苯二甲酸酯(PAEs)是持久性有机污染物的重要类别,其同系物快速增长使组特异性检测需求迫切。DNA适配体可作为生物传感器识别元件,但针对PAEs等高疏水小分子的适配体筛选报道很少。本文报道一种基于微球的PAEs组特异性DNA适配体筛选方法。作者合成氨基功能化邻苯二甲酸二丁酯(DBP-NH2)作为锚定靶标,固定在环氧活化琼脂糖微球上...
Advanced drug delivery reviews
2018
Röthlisberger P, Hollenstein M
适配体是通过体外系统进化指数富集(SELEX)获得的单链 DNA 或 RNA 分子,能够高亲和力、高选择性结合特定目标物。与抗体相比,适配体具有免疫原性低、可低成本大规模合成、批次差异小、物理稳定性较好且易于化学修饰等优势,因此被广泛用于治疗、诊断和生物传感平台开发。然而,适配体的商业化进展仍较慢,主要限制包括易被核酸酶降解、肾清除...
Talanta
2018
Sadeghi AS, Mohsenzadeh M, Abnous K, Taghdisi SM 等 5 人
本研究利用基于磁珠的系统进化指数富集(SELEX)技术,从富集核苷酸文库中筛选出针对抗生素氟苯尼考(FF)的特异性单链DNA适配体。经过12轮筛选获得36条序列,并按一级序列相似性分为5个主要家族。对来自不同家族的3个荧光标记适配体进行结合亲和力分析,其解离常数(Kd)处于低纳摩尔范围(52.78–211.4 nmol L−1)。在...
RNA biology
2018
Bala J, Chinnapaiyan S, Dutta RK, Unwalla H
适配体是高亲和力单链核酸或蛋白质配体,特异性与亲和力可媲美甚至超过抗体,可通过系统进化指数富集(SELEX)在体外筛选。其功能依赖独特三级结构和折叠形成的结合口袋,解离常数常为皮摩尔至低纳摩尔。稳定、低毒的适配体可针对小分子至大蛋白,并用于治疗、诊断、生物传感器和生物成像。相比抗体,适配体可化学合成,成本低、审批简便、免疫原性低。H...
Biochimie
2018
Toulmé JJ, Azéma L, Darfeuille F, Dausse E 等 6 人
2017年9月22—23日,约150名参会者参加了在法国波尔多交易所宫举办的‘Aptamers in Bordeaux’研讨会。来自世界各地的30位报告人作了学术报告,内容涵盖适配体的筛选流程、适配体化学及其创新应用,并强调这类强效工具相对于抗体的显著优势。除呈现出色的科学内容外,与会者之间的热烈讨论和富有成效的交流也使本次会议取得...