化学发光生物传感器 2008

A novel label-free biosensor using an aptazyme-suppressor-tRNA conjugate and an amber mutated reporter gene.

Chembiochem : a European journal of chemical biology Ogawa A, Maeda M
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组成图示

A novel label-free biosensor using an... 传感器构成示意图

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传感器类型

化学发光生物传感器

检测对象

茶碱(theophylline);样品基质:体外无细胞翻译反应液(含 0–1 mM 茶碱)

检测原理

该传感器以茶碱依赖 aptazyme 作为识别元件,以抑制 tRNA 和突变荧光素酶基因作为信号转导与报告元件。无茶碱时,aptazyme 与 supT 形成 AST,5′端额外结构阻止 SerRS 对 supT 氨酰化,核糖体在 S60UAG 的 UAG 处停滞,不产生有活性 luciferase。茶碱结合 aptazyme 后诱导其自切割,释放成熟 supT;SerRS 将其氨酰化,氨酰化 supT 竞争进入停滞核糖体并抑制 UAG,使翻译继续至终止 UAA,合成全长 luciferase。luciferase 催化化学发光底物产生 CL 信号,信号强度随茶碱浓度升高而增强。该过程通过无细胞翻译将 RNA 开关状态转换为蛋白表达,实现无标记、低检测器依赖的传感。

检测灵敏度

原文未报告 LOD、线性范围、灵敏度斜率或相关系数。

效应效果

该传感器在 1 mM 茶碱下,AST3 的 ON/OFF 效率为 6.8±1.1;经 helix A 长度优化并引入错配后,AST4m 的 ON/OFF 效率为 11.6±1.2,约为 AST3 的两倍,且表现出较高茶碱依赖性。作者认为其效率略高于或可与其他茶碱依赖 aptazyme 相当,但低于原始 aptazyme,原因包括额外序列降低核酶活性、翻译温度略高及 Mg2+ 浓度略低。系统无需标记 aptazyme 或特殊检测器,部分情况下可无检测器读取,具有向活细胞基因调控应用扩展的潜力;文中未报告选择性、抗干扰、稳定性、RSD 或实际样品回收率。

传感器的构成

  • 反应体系/换能介质:RF1-free reconstituted prokaryotic cell-free translation system(PURESYSTEM custom, Post Genome Institute),含 T7 RNA polymerase(T7RNAP)、核糖体与氨基酸,提供无细胞转录翻译环境
  • 识别元件:theophylline-dependent aptazyme(茶碱依赖 aptazyme),结合茶碱后发生自切割,将结合事件转换为 RNA 结构变化
  • 信号转导元件:anticodon-adjusted suppressor tRNA^SerU CUA(supT),与 aptazyme 5′端连接形成 AST,被 SerRS 氨酰化后抑制 UAG 密码子
  • 报告基因:amber-mutated luciferase gene(S60UAG),含 UAG 琥珀密码子,无目标时翻译停滞,有目标时合成全长 luciferase
  • 信号酶:luciferase(荧光素酶),催化 luciferase assay reagent 中的底物产生化学发光
  • 读出试剂:luciferase assay reagent(Promega),提供化学发光底物
  • 读出仪器:Wallac 1420 ARVOsx 与 Las4000,测量化学发光强度或成像

中文摘要

本文报道了一种新型无标记、基于 aptazyme 的生物传感器。该传感器将茶碱依赖 aptazyme 连接到琥珀密码子抑制 tRNA^SerU CUA 的 5′端,形成 aptazyme–suppressor tRNA 共轭物(AST),并与含 UAG 琥珀密码子的突变荧光素酶报告基因(S60UAG)共同置于无 RF1 的原核无细胞翻译体系中。无茶碱时,AST 5′端额外序列使抑制 tRNA 不能被氨酰-tRNA 合成酶识别和氨酰化,核糖体在 UAG 处停滞,不产生有活性荧光素酶;茶碱结合后诱导 aptazyme 自切割,释放并激活抑制 tRNA,使其被 SerRS 氨酰化并掺入停滞核糖体,翻译继续至终止密码子,产生全长荧光素酶。通过优化 helix A 长度并引入错配,AST4m 传感器在 1 mM 茶碱下 ON/OFF 效率达 11.6±1.2,约为 AST3 的两倍,具有较高茶碱依赖性,且无需标记或特殊检测器,可潜在用于活细胞基因调控。

英文摘要

关键词

生物传感器aptazyme抑制tRNA无义密码子抑制茶碱化学发光