Modulation of DNA-polyamide interaction by β-alanine substitutions: a study of positional effects on binding affinity, kinetics and thermodynamics.

Organic & biomolecular chemistry 2014 Wang S, Aston K, Koeller KJ, Harris GD 等 7 人

发夹多聚酰胺（hairpin polyamides, PAs）是一类重要的序列特异性 DNA 小沟结合剂，常引入 β-丙氨酸（β）以降低分子刚性并维持 DNA 识别注册。为系统理解 β 对 DNA–PA 结合亲和力、选择性尤其是动力学的影响，作者以八杂环发夹 PA KA1033 及其 β 衍生物为对象，将其内部吡咯系统性地替换为单个...

综述或非传感器论文 多聚酰胺DNA小沟结合β-丙氨酸取代表面等离子共振

Correlation of local effects of DNA sequence and position of β-alanine inserts with polyamide-DNA complex binding affinities and kinetics.

Biochemistry 2012 Wang S, Nanjunda R, Aston K, Bashkin JK 等 5 人

为深入理解β-丙氨酸（β）取代及杂环数目对DNA结合亲和力与选择性的影响，作者研究了八环发夹聚酰胺（PA）及其两个β衍生物和一个六环类似物与同源DNA序列5′-TGGCTT-3′的相互作用，并利用同源DNA和五个突变DNA评估结合选择性与β效应。研究采用互补的能量与结构方法，包括紫外热熔融、生物传感器表面等离子共振（SPR）、等温滴...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 聚酰胺DNA小沟结合β-丙氨酸取代结合亲和力