Improving the Accuracy of a Biohybrid for Environmental Monitoring.
环境监测应尽量减少对生态系统的干扰。Robocoenosis 项目提出使用生物混合体（biohybrid）融入生态系统，并利用生命形式作为传感器。然而，此类生物混合体在存储与供电能力上受限，只能采样有限数量的生物个体。本文对该生物混合体进行建模，研究在有限样本条件下可获得的估计准确度，并重点考虑会降低准确度的误分类错误，即假阳性与假...
Accurate Identification of Diverse N-acyl Homoserine Lactones in Marine Vibrio fluvialis by UHPLC-MS/MS.
河弧菌（Vibrio fluvialis）是海洋机会致病菌，可产生群体感应信号分子 N-酰基高丝氨酸内酯（AHL），介导毒力相关基因表达。已有研究通过生物法和理化法检测到多种 AHL，但不同方法所得 AHL 谱存在差异。本文报道从东海海洋沉积物中分离的产 AHL 菌株 V. fluvialis BJ-1。该菌株可诱导生物传感器农杆菌...
Reprogrammed tracrRNAs enable repurposing of RNAs as crRNAs and sequence-specific RNA biosensors.
在II型CRISPR系统中，向导RNA（gRNA）由CRISPR RNA（crRNA）和反式作用CRISPR RNA（tracrRNA）组成，二者对Cas9引导的DNA靶向均不可或缺。尽管不同II型CRISPR系统的tracrRNA序列和结构多样，但Cas9中crRNA-tracrRNA杂交的可编程性尚未完全阐明。本文系统揭示了链球...
Comprehensive Profiling of Diverse Genetic Reporters with Application to Whole-Cell and Cell-Free Biosensors.
全细胞与无细胞转录-翻译生物传感器因成本低、环保且易用，正成为传统检测方法的替代方案。其生物响应需转换为易检测的物理化学信号，遗传报告基因选择对性能至关重要，但以往多依赖经验试错。本文在汞离子和群体感应分子两个代表性传感器中，系统比较八种报告基因：荧光类（gfpmut3、deGFP、mCherry、mScarlet-I）、比色类（l...
Developing a circularly permuted variant of Renilla luciferase as a bioluminescent sensor for measuring Caspase-9 activity in the cell-free and cell-based systems.
由生物分子和活细胞构成的生物传感器与全细胞生物传感器能够感知生物体系中的特定刺激，并将其转换为可测量信号。其中，基于荧光素酶的生物发光传感器在分子生物学和成像系统中应用广泛。本项目利用圆形排列策略设计并构建了一种用于检测和定量 Caspase-9 活性的荧光素酶生物传感器。光谱学结果表明，圆形排列导致该传感器结构发生改变。随后，研究...
Evaluation of the leucine incorporation technique for detection of pollution-induced community tolerance to copper in a long-term agricultural field trial with urban waste fertilizers.
铜（Cu）因城市废物产品作为肥料施用而在农业土壤中累积。本研究报道利用亮氨酸掺入技术（Leu-PICT）在长期农业田间试验中测定土壤细菌群落对铜的污染诱导群落耐受性。结果显示，施用有机废物肥料的土壤中细菌群落对 Cu 的耐受性显著升高，并与土壤总 Cu 含量呈正相关。然而，金属形态分析和全细胞细菌生物传感器分析表明，所观察到的 PI...
Development of an online biosensor for in situ monitoring of chlorine dioxide gas disinfection efficacy.
本研究设计并构建了一种基于生物发光的原型生物传感器，用于在不同处理条件下在线评估二氧化氯（ClO2）气体的抗菌消毒效力。该传感器由发光报告菌荧光假单胞菌 Pseudomonas fluorescens 5RL、光电倍增管（PMT）光学换能器以及容纳报告菌和换能器的光密腔体组成。重组 P. fluorescens 5RL 携带 lux...