Reversible domain closure modulates GlnBP ligand binding affinity.
谷氨酰胺结合蛋白（GlnBP）是大肠杆菌周质结合蛋白，负责结合并携带谷氨酰胺至内膜 ATP 结合盒（ABC）转运体。等温滴定量热（ITC）测得 GlnBP 与谷氨酰胺的结合亲和力约为 0.1 μM，且配体结合通过提高热力学稳定性稳定蛋白结构。然而，决定 GlnBP 配体结合的分子机制尚不清楚。静电作用和疏水作用是 GlnBP 与谷氨...
Structural Analysis of a Genetically Encoded FRET Biosensor by SAXS and MD Simulations.
受天然信号蛋白模块化结构启发，配体结合蛋白可融合两个荧光蛋白（FP）构建基于 Förster 共振能量转移（FRET）的生物传感器。本研究以葡萄糖传感器为例，将供体与受体荧光蛋白通过不同连接序列连接至葡萄糖结合蛋白，形成多种传感器构象体。对其中三种构象体，利用小角 X 射线散射（SAXS）测量葡萄糖诱导的构象变化，并与已发表的单分子...
Reversible and irreversible fluorescence activity of the Enhanced Green Fluorescent Protein in pH: Insights for the development of pH-biosensors.
增强绿色荧光蛋白（EGFP）具有强而天然的荧光，在生物医学研究中广泛用作生物标志物，但作为生物传感器时，其结构和在不利环境中的行为认识不足。本研究利用三维荧光光谱、圆二色（CD）和小角X射线散射（SAXS）系统评估不同 pH 下 EGFP 的荧光活性与结构变化，并重点考察 pH 诱导荧光猝灭的可逆性，以期为开发生物相容的 pH 生物...
Structure and function of the juxtamembrane GAF domain of potassium biosensor KdpD.
KdpD/KdpE 双组分信号系统调控高亲和力钾离子转运体表达，维持钾稳态。KdpD 的 C 端模块由 GAF 域连接组氨酸激酶域组成。某些 GAF 域通过结合环核苷酸发挥调控作用，但 KdpD 中近膜 GAF 域的功能未知。作者报道了 KdpD GAF 域（KdpDG）的高分辨晶体结构，其由 5 条 α 螺旋、4 个 β 折叠和 ...
Enzyme-Triggered Dissociation of a FRET-Based Protein Biosensor Monitored by Synchrotron SAXS.
蛋白生物传感器广泛用于监测活细胞及体外体系中的代谢物浓度和酶活性。中性粒细胞弹性蛋白酶（neutrophil elastase, NE）是一种与炎症疾病相关的丝氨酸蛋白酶，其活性若不受调控可导致病理状态。本研究聚焦于一种基于 Förster 共振能量转移（FRET）的 NE 活性生物传感器的结构表征。该传感器由黄色荧光蛋白（YFP）...
Highly selective tungstate transporter protein TupA from Desulfovibrio alaskensis G20.
钼和钨以可溶性氧阴离子形式经细菌和古菌的高亲和 ATP 结合盒（ABC）转运系统摄取，其中组分 A（ModA/TupA）是细胞区分 MoO4^2−、WO4^2− 及其他相似氧阴离子的第一道选择门。本文报道了来自阿拉斯加脱硫杆菌 G20 的 apo-TupA 蛋白的生化表征及 1.4 Å 分辨率晶体结构。小角 X 射线散射（SAXS）...
Conformational analysis of a genetically encoded FRET biosensor by SAXS.
遗传编码的Förster共振能量转移（FRET）传感器是现代细胞生物学的重要工具，其构象变化会改变供体-受体发射比，从而在时间和空间上监测靶分子变化及酶活性。FRET传感器广泛用于追踪磷酸化事件和钙离子升高。本文首次将体外与细胞内FRET测量和小角X射线散射（SAXS）相结合，在低分辨率水平上分析传感器功能相关的构象变化。研究系统表...