ACS chemical biology
2025
Paul A, Terrell JR, Farahat AA, Ogbonna EN 等 8 人
随着已知基因组序列数量与多样性增加,利用可穿膜小分子调控基因表达的机会不断增多。增强小沟结合剂对 DNA 序列的识别能力,有望拓展其在转录因子调控等领域的应用。现有小沟结合剂可识别纯 AT 或 AT/GC 混合序列,但难以区分不同 AT 序列。本文报道了一类可选择性结合含 -TTAA- 或 -TATA- 小沟序列、而非其他 AT 序...
Chemical science
2021
Guo P, Farahat AA, Paul A, Boykin DW 等 5 人
本文报道了设计 DNA 小沟结合剂以识别任意 DNA 序列项目中的突破,重点解决长期难以靶向的相邻 GG 序列。作者尝试多种化合物设计后,选择 N-烷基苯并二咪唑结构,使其为相邻 GG 碱基的小沟 N-H 提供两个氢键受体;两侧噻吩单元提供预组织构象和强亲和力,末端苯甲脒终止分子,得到 DB2831。DB2831 与目标 AAAGG...
Nucleic acids research
2016
Harika NK, Paul A, Stroeva E, Chai Y 等 7 人
DNA 序列特异性结合对于靶向转录因子-DNA 复合物以调控基因表达至关重要。杂环双胍化合物 DB2277 可特异性识别 AAAGTTT 型混合碱基序列小沟中的单个 G•C 碱基对。核磁共振(NMR)光谱显示结合态化合物存在主要和次要两种物种。为理解决定混合 DNA 序列中结合亲和力与取向的原理,作者用 NMR 和热熔实验考察了三十...
Nanoscale research letters
2015
Tan S, Wang L, Yu J, Hou C 等 7 人
纳米孔已被证明是用于未标记生物大分子单分子检测与表征的新型通用传感器。在本研究中,利用聚焦镓离子束(FIB)成功制备了直径约60 nm的较大硅氮化物(Si3N4)纳米孔,并展示了一种简单的体外硅烷化程序,以控制固态纳米孔的尺寸与功能。研究结果表明,通过改变硅烷化时间,可以调节探针分子的固定效率,从而将孔径收缩至所需尺寸,同时引入选择...
Biosensors & bioelectronics
2014
Miao X, Guo X, Xiao Z, Ling L
双链DNA(dsDNA)是天然DNA的主要存在形式,其序列特异性直接识别对疾病诊断和基因治疗具有重要意义。本文报道了一种基于二茂铁(Fc)氧化还原探针标记分子信标(MB)结构变化的电化学传感器,用于序列特异性识别dsDNA。首先将金纳米颗粒(AuNPs)电化学沉积到玻璃碳电极(GCE)表面,再通过Au–S键将巯基化MB以折叠茎环状态...
The Analyst
2013
Chen L, Zheng H, Zhu X, Lin Z 等 8 人
本文报道了一种基于金属有机框架(MOF)的简单、低成本、高灵敏且高选择性的荧光生物传感器,用于体外序列特异性识别双链 DNA(ds-DNA)。作者选用 N,N-双(2-羟乙基)二硫代草酰胺合铜(II)(H2dtoaCu)作为 MOF 传感平台,因其能强烈化学吸附荧光标记的三链形成寡核苷酸探针(TFO),并通过光诱导电子转移猝灭染料荧...
The Analyst
2011
Wu C, Zhou Y, Miao X, Ling L
本文基于染料标记单链DNA与双链DNA的杂交,开发了一种以氧化石墨烯(GO)为平台的荧光生物传感器,用于序列特异性识别双链DNA(dsDNA)。FAM标记的单链DNA(ssDNA)吸附于GO表面时,其荧光被GO通过荧光共振能量转移淬灭。加入目标dsDNA后,SV40病毒T抗原基因4424–4440(gp6)区的同嘧啶/同嘌呤双链片段...