随着已知基因组序列数量与多样性增加，利用可穿膜小分子调控基因表达的机会不断增多。增强小沟结合剂对 DNA 序列的识别能力，有望拓展其在转录因子调控等领域的应用。现有小沟结合剂可识别纯 AT 或 AT/GC 混合序列，但难以区分不同 AT 序列。本文报道了一类可选择性结合含 -TTAA- 或 -TATA- 小沟序列、而非其他 AT 序...
本文延续 Ken Breslauer 等关于小分子阳离子与 DNA 小沟结合热力学的基础研究，系统考察了具有不同末端阳离子基团的吡啶基序列特异性小沟结合剂与 DNA 的结合热力学。作者采用生物传感器-表面等离子共振（biosensor-SPR）和等温滴定量热（ITC）方法，从两方面拓展小沟结合剂研究：一是使用可识别含单个 G•C 碱...
DNA 序列特异性结合对于靶向转录因子-DNA 复合物以调控基因表达至关重要。杂环双胍化合物 DB2277 可特异性识别 AAAGTTT 型混合碱基序列小沟中的单个 G•C 碱基对。核磁共振（NMR）光谱显示结合态化合物存在主要和次要两种物种。为理解决定混合 DNA 序列中结合亲和力与取向的原理，作者用 NMR 和热熔实验考察了三十...
鉴于双胍类化合物作为靶向 DNA 的治疗药物和生物技术试剂日益重要，有必要明确结构相近化合物与不同 AT 序列结合位点相互作用的热力学差异。本研究采用生物传感器-表面等离子共振（SPR）、等温滴定量热（ITC）、圆二色（CD）、热熔融（Tm）和分子建模等方法，系统表征了与 DB75（胍基-苯基-呋喃-苯基-胍基）相关的二价双胍化合物...
传统 DNA 小沟结合剂模型要求分子呈新月形以匹配小沟螺旋曲率，但近年发现一些相对线性且二面角扭转较大的化合物也能强结合小沟，这促使研究者考察曲率要求可放宽的程度。作为实验分析的第一步，作者合成了线性三苯基双胍 DB1111 及一系列含氮三环类似物，旨在将 GC 结合选择性引入可进入细胞并发挥生物效应的杂环化合物。这些化合物从胍基碳...