Assembly of long L-RNA by native RNA ligation.
由于 L-寡核苷酸具有内在核酸酶抗性，其在分子工具与传感器开发中应用日益增加，但长链 L-寡核苷酸的合成仍具挑战，可能限制未来应用。本文报道了一种简便且通用的策略，利用 T4 RNA 连接酶 1 将两个或多个较短片段组装为长链 L-RNA。作者设计了在 5′ 和 3′ 末端含有 D-核糖核苷酸的 L-RNA 供体与受体片段，通过 T...
A malachite green light-up aptasensor for the detection of theophylline.
生物传感器可用于代谢物、药物和污染物等小分子的定量检测，荧光技术因易于与适配体结合而被广泛采用。亮灯适配体是一类寡核苷酸，能与孔雀石绿（MG）等荧光原配体特异性结合并诱导荧光发射。作者设计了一种用于检测茶碱（theophylline, Th）的双适配体开关传感器，将 MG 特异性发夹适配体和 Th 特异性发夹适配体分别改造为 mal...
Optimization of fluorogenic RNA-based biosensors using droplet-based microfluidic ultrahigh-throughput screening.
生物传感器是能够检测并报告目标分子存在的生物分子。核酸因其结构可塑性强、可与多种配体特异性结合，并在识别后发生结构重排以触发报告事件，而成为设计此类分子的理想材料。典型生物传感器由传感域、报告域以及负责在分子内传递传感事件的通讯模块三部分组成；通讯模块是传感器的关键元件，通常依赖试错法经验性开发，且往往只测试少量组合。本文提出一种结...
Quality control certification of RNA aptamer-based detection.
RNA 是具有多种功能的生物大分子，可衍生出大量具有优异结合亲和力与特异性的 RNA 适配体，是生物传感器开发的理想识别元件。然而 RNA 易发生自发水解和核酸酶降解，导致 RNA 适配体传感器易产生假阳性信号。本文提出一种利用内部质量控制元件区分目标结合与假阳性信号的 RNA 适配体生物传感器设计策略。所选 RNA 适配体序列被扩...
Stabilizing structure-switching signaling RNA aptamers by entrapment in sol-gel derived materials for solid-phase assays.
结构转换荧光信号DNA和RNA适配体已被报道为生物传感器开发中高度通用的分子识别元件。虽然结构转换DNA适配体已用于固相传感，但等效RNA适配体由于化学稳定性差且易受核酸酶攻击，尚未成功用于固相传感器。本研究考察将结构转换荧光信号RNA适配体报告分子包埋到溶胶-凝胶衍生有机无机复合材料中，作为固相固定化平台，并以合成茶碱结合和天然焦...