Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2026
Li X, Tan SK, Chung CI, Hatstat AK 等 8 人
蛋白激酶调控几乎所有主要信号通路,因此可视化激酶活性的时空动态对理解细胞信号至关重要。本文报道了一种从头设计的激酶活性报告子,命名为 NOVARK,其由单条多肽链组成,包含多个模块化基序,分别作为特异性激酶底物和报告元件。NOVARK 可发生磷酸化诱导的高阶组装,表现为超亮 GFP 液滴,其动态范围大于现有基于 Förster 共振...
Journal of microbiology and biotechnology
2025
Kim D, Seo J, Jeon TJ
细胞内钙离子(Ca2+)在信号转导、细胞运动与发育等过程中发挥关键作用。尽管细胞内钙动态研究广泛,但胞外钙如何调控胞内钙水平仍不清楚。本研究构建了表达钙生物传感器 GCaMP3 的盘基网柄菌特异性质粒,并在活细胞中实时可视化胞内钙波动。外源钙刺激下,营养期细胞胞内钙快速短暂升高,约 20 s 达峰;而具聚集能力细胞无此响应。Gβ 缺...
ACS sensors
2024
Zhou J, Liu X, Zhang D, Ma G
微管(MT)动态受微管相关蛋白(MAPs)和微管蛋白翻译后修饰(PTMs)精细调控。本文报道了两种遗传编码的寡聚化微管结合蛋白 OligoMT 与 OligoTIP,用于活细胞内实时可视化和操控微管行为。OligoMT 由 p73 寡聚化结构域(OD)与 CLIP170 微管结合结构域(MTBD)融合而成,可作为可靠标记物标记微管骨...
Chembiochem : a European journal of chemical biology
2024
Mann N, Hill J, Wang K, Hughes RM
肌动蛋白细胞骨架是细胞应激的生物传感器,也是人类疾病的潜在预后指标。异常骨架结构,如能量和氧化应激诱导形成的应激颗粒,与衰老、癌症、心血管疾病和病毒感染密切相关。这些骨架现象能否被用于开发检测骨架功能障碍乃至疾病进展的生物传感器,仍是开放问题。本文报道了 profilin 的光遗传版本 OptoProfilin 的设计与开发。pro...
iScience
2023
Gutierrez B, Aggarwal T, Erguven H, Stone MRL 等 11 人
脂质膜和富脂细胞器是硝化应激下产生的高活性物种过氧亚硝酸盐(ONOO−)的重要靶点。本文报道一种膜定位磷脂探针DPPC-TC-ONOO−,用于在多种脂质环境中检测ONOO−,包括仿生囊泡、哺乳动物细胞区室和肺衬液。DPPC-TC-ONOO−与POPC自组装成膜囊泡,可荧光且选择性地响应ONOO−。通过脂质纳米颗粒递送后,该探针能在细...
Journal of visualized experiments : JoVE
2023
Richardson TM, Pettway YD, Walker JT, Nelson HA 等 11 人
朗格汉斯胰岛是分散于胰腺中的小型三维内分泌与支持细胞集合,通过β细胞分泌胰岛素降低血糖、α细胞分泌胰高血糖素升高血糖,在血糖稳态调控中起核心作用。包括cAMP介导通路在内的细胞内信号通路对α和β细胞激素分泌的调控至关重要。然而,胰岛的三维结构给原代人胰岛细胞内信号机制研究带来实验挑战。为克服这些限制,本文描述一种整合活细胞成像与微流...
bioRxiv : the preprint server for biology
2023
Mann N, Hill J, Wang K, Hughes RM
肌动蛋白细胞骨架可反映细胞应激,并可能作为人类疾病的预后指标。特别是由能量和氧化应激诱导形成的异常细胞骨架结构,如 cofilin-actin 棒和应激颗粒,与阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病密切相关。这些细胞骨架现象能否被用于开发检测细胞骨架功能障碍及神经退行性疾病进展的生物传感器,仍是开放问题。本研究设计并...
Cells
2023
White D, Lauterboeck L, Mobasheran P, Kitaguchi T 等 6 人
三磷酸腺苷(ATP)是细胞能量货币,约90%由线粒体产生,少于10%由胞质产生。代谢变化对细胞ATP动态的实时影响仍不明确。本文报道遗传编码荧光ATP指示剂smacATPi的设计与验证,可在培养细胞中实时、同时可视化胞质和线粒体ATP。该双指示剂由先前描述的胞质和线粒体ATP指示剂组合而成。在HEK293T细胞中,糖酵解抑制剂2-脱...
Molecular biology of the cell
2023
Rahman SMT, Haugh JM
细胞外调节蛋白激酶(ERK)信号通路在细胞生长、增殖和分化中起关键作用。ERK 信号具有动态性,涉及磷酸化/去磷酸化、核质穿梭以及胞质和核内多种蛋白底物的相互作用。利用遗传编码 ERK 生物传感器进行活细胞荧光显微镜观察,有望在单细胞水平推断这些动力学。本研究在相同的细胞刺激条件下,监测了四种常用转位型和 Förster 共振能量转...
Biosensors & bioelectronics
2022
Tang Y, Zhang D, Lu Y, Liu S 等 7 人
flap内切酶1(flap endonuclease 1, FEN1)是一种结构特异性核酸酶,可催化去除特定DNA结构中的5′单链突出片段。由于FEN1在多种肿瘤细胞中过表达并与癌症进展密切相关,其被视为潜在癌症生物标志物。本文以氨基化介孔二氧化硅纳米颗粒(NH2-MSNs)为荧光纳米探针载体,利用其丰富介孔结构负载罗丹明6G(Rh...
ACS applied materials & interfaces
2022
Wang Y, Chen Y, Wan Y, Hong C 等 8 人
多聚核苷酸激酶(PNK)通过调控磷酸化过程参与多种细胞事件,其稳态异常与多种人类疾病相关。本文提出一种自催化杂交体系(AHS),通过巧妙整合杂交链组装(HCA)与催化DNA组装(CDA),实现高效正反馈放大。PNK靶向AHS生物传感器由识别模块、HCA放大模块和CDA自催化模块组成。存在PNK时,识别模块将PNK输入转化为暴露的核酸...
Molecular carcinogenesis
2021
Yin R, Song J, Esquela-Kerscher A, Kerscher O
SUMO 是一种小泛素样修饰蛋白,可与细胞蛋白或自身共价连接形成 SUMO 结合物和 SUMO 链。在正常生长条件下,细胞维持 SUMO 结合物水平平衡;当受到蛋白毒性或基因毒性应激时,真核细胞会启动细胞保护性 SUMO 应激反应(SSR),其典型特征是氧化、热和渗透应激后 SUMO 结合物快速且大量增加。本研究使用重组荧光 SUM...
Glia
2021
Müller FE, Cherkas V, Stopper G, Caudal LC 等 9 人
近期荧光指示剂与成像技术的进步推动了对活细胞复杂信号过程(如钙离子活动模式)的功能成像研究。星形胶质细胞是脑网络的重要调节者,具有高度复杂的形态和自发钙活动,但领域缺乏标准化方法来分析与解释钙活动记录,限制了全球比较。本文提出一种基于生物物理的解析概念,用于解析钙生物传感器荧光中复杂时空变化,以理解潜在信号机制。作者开发了基于像素的...
Bio-protocol
2021
Birk J, Lizak B, Appenzeller-Herzog C, Odermatt A
活性氧(ROS)的产生与内质网(ER)应激密切相关,ROS 既可能是 ER 应激的诱因,也可能是其后果;多种人类疾病表现为 ER 应激和氧化损伤导致的组织萎缩。为评估 ER 腔内 ROS 生成调节剂并开展机制研究,需要能够时间分辨、细胞器特异性地监测 ER 氧化还原状态的方法。基因编码荧光探针的发展使这一目标成为可能,其中基于黄色荧...
Nature methods
2021
Zhang S, Li X, Zhao S, Drobizhev M 等 5 人
本撤稿说明针对一篇报道遗传编码荧光血清素生物传感器 G-GESS 的论文。作者最初称 G-GESS 由蜱脂卡蛋白工程化而来,可用于在培养细胞、脑片和行为小鼠中成像血清素。作者及实验室其他未参与原研究的研究者表示,在原始条件下无法重复部分关键结果。使用 pDisplay-G-GESS-M 质粒转染 HEK293T 细胞时,传感器膜定位...
Redox biology
2021
Alshaabi H, Shannon N, Gravelle R, Milczarek S 等 6 人
线粒体通过微管马达、肌动蛋白骨架和适配蛋白在细胞内运输,其定位支持局部ATP、Ca2+和活性氧(ROS,即H2O2)水平。此前发现敲除线粒体适配蛋白Miro1使线粒体聚集于核周,损害周边能量状态。本研究报道,Miro1缺失将亚细胞H2O2限制在核周,并影响细胞对线粒体ROS升高的应答。利用遗传编码H2O2响应荧光生物传感器HyPer...
Cell chemical biology
2019
Kim H, Jaffrey SR
Corn是一种荧光RNA适配体,可形成高亲和力准对称同源二聚体;其二聚体界面结合DFHO后产生高度光稳定的黄色荧光。由于光漂白会限制RNA小分子生物传感器的定量准确性,Corn的光稳定性使其适用于此类传感器。本文提出将组成型Corn二聚体转化为小分子调控荧光生物传感器的策略,用于在体外和活细胞中检测S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。作者将...
Genetics
2019
Cianciulli A, Yoslov L, Buscemi K, Sullivan N 等 10 人
睡眠在进化上保守,研究线虫等简单无脊椎动物可在单细胞水平揭示睡眠机制。跨物种保守的睡眠调控通路涉及环磷酸腺苷(cAMP),它作为第二信使激活蛋白激酶A。线虫在环境损伤引起的细胞应激后出现应激诱导睡眠(SIS),是研究疾病相关睡眠的模型,且由简单神经回路控制,便于解析睡眠中的 cAMP 信号。作者利用红光激活的腺苷酸环化酶 IlaC2...
Nature biotechnology
2019
Litke JL, Jaffrey SR
RNA适配体及基于适配体的RNA装置可遗传编码并在细胞内表达,用于探测和操控细胞功能,但在哺乳动物细胞中因表达量低、降解快而应用受限。本文报道Tornado(Twister-optimized RNA for durable overexpression)表达系统,通过快速RNA环化获得高稳定性与高表达水平的RNA适配体。Torna...
Journal of materials chemistry. B
2018
Kong TT, Zhao Z, Li Y, Wu F 等 6 人
本文报道了一类基于聚集诱导发光(AIE)策略即时检测活细菌的荧光传感分子。作者合成了含多个四苯乙烯(TPE)核心苯硼酸单元的 AIE 探针 TriPE-3BA 和 TPE-4BA。这些探针通过苯硼酸与细菌表面多糖/肽聚糖上的顺式二醇或羟基发生可逆结合,使周围苯环旋转受限并形成聚集态,从而产生蓝色 AIE 荧光。含两个苯硼酸单元的 T...