用于光学蛋白酶检测的肽-纤维素共轭物因其在即时检测（POC）中的应用潜力而受到关注。慢性病患者中丝氨酸蛋白酶水平常升高，因此需要优化生物传感器设计以支持 POC 评估。纳米纤维素可作为蛋白酶传感器的换能表面，其生物相容性和高比表面积有助于灵敏检测稀薄生物标志物。然而，要改进蛋白酶传感器设计，仍需理解换能表面与传感器分子在时空上的关系...
钙/钙调蛋白（Ca2+/CaM）依赖的蛋白信号调控在肌肉发育、免疫应答、心肌功能及神经元连接可塑性中具有重要作用。在兴奋性神经元中，Ca2+经NMDA受体内流并结合钙调蛋白（CaM），进而调控下游钙调蛋白结合蛋白（CBP）的激活；不同CBP对Ca2+输入频率具有选择性“调谐”。作者将此前描述CBP竞争结合CaM的确定性模型扩展，纳入...
基于 Förster 共振能量转移（FRET）的生物传感器可用于可视化生物和生理过程，并能在空间与时间维度提供详细信息。在 FRET 型生物传感器中，底物结合会引起两个荧光团相对位置变化，从而改变 FRET 效率，并可在荧光光谱中观察到。因此，其设计需要一种结合配体后发生构象变化的配体结合蛋白。然而，并非所有配体结合蛋白在与荧光蛋白...
本文报道了一种基于计算建模设计的肽库，并筛选出两条对赭曲霉毒素A（OTA）具有亲和力的肽序列。研究以20种天然氨基酸为构建单元，利用从头设计程序 LeapFrog 和动态建模软件 FlexiDock，围绕 OTA 模板设计短肽库，并根据计算结合得分排序。从数据库中选择两条高分肽：八肽 N'-Cys-Ser-Ile-Val-Glu-A...
许多荧光探针依赖荧光蛋白对之间的荧光共振能量转移（FRET）来报告细胞事件。当融合传感蛋白响应细胞事件发生构象变化时，供体与受体之间的能量转移效率随之改变，因此可通过FRET效率变化关联目标分子或细胞过程。本文介绍基于结构的计算设计策略：利用候选FRET生物传感器各结构域的三维结构，对柔性连接区进行构象采样，并预测距离因子、取向因子...
理解细胞功能常需对复杂胞内通路进行定量描述。荧光寿命成像显微镜（FLIM）结合 Förster 共振能量转移（FRET）分子生物传感器的发展，使活细胞内生化活性的精确测量成为可能。本文讨论如何将定量活体成像与体外生化表征相结合，建立用于模拟生化网络行为的计算系统模型，并以有丝分裂纺锤体组装中 Ran GTPase 功能的计算建模为例...