Engineered Biosensors from Dimeric Ligand-Binding Domains.
生物传感器是合成生物学和代谢工程应用中的重要组成部分。本文报道了基于失稳二聚体配体结合域的第二代酿酒酵母地高辛和孕酮生物传感器，其通过配体诱导稳定发挥作用。该生物传感器由一个配体结合域单体融合 DNA 结合域、另一个融合转录激活域组成，在配体结合和受体二聚化后激活报告基因表达。在二聚界面引入失稳突变使生物传感器动态范围提高一个数量级...
The Applications of Promoter-gene-Engineered Biosensors.
启动子是DNA序列中响应转录因子并启动特定基因表达的小区域。启动子工程生物传感器可通过转录因子识别多胺、糖、内酰胺、氨基酸、有机酸或氧化还原分子，从而激活或抑制基因表达；但相关应用报道较少。本综述介绍了利用人和细菌遗传启动子阵列构建启动子-基因工程生物传感器的策略，并讨论其在高通量筛选（HTS）分子药物、膜蛋白定位与核质穿梭机制研究...
Blueprints for Biosensors: Design, Limitations, and Applications.
生物传感器正在推动分析检测领域的重要进展，并与合成生物学的发展相互促进。生物传感器能够快速、特异性地检测多种分子，在工业、医学、生态和科学研究中具有广泛应用。生物传感器设计方法与其应用一样多样，主要类别包括核酸、蛋白质和转录因子。每一类传感器都依据目标应用和最佳性能参数具有不同优势与局限。具体而言，传感器设计必须考虑配体特异性、灵敏...
A protocatechuate biosensor for
稳健的荧光型生物传感器已成为合成生物学中高通量菌株改良的关键工具。许多传感器在大肠杆菌等模式生物中开发，但工业微生物常具有目标工艺所需的优势表型，传感器跨宿主转移时可能出现灵敏度与动态范围下降。本文展示了一种通用策略，通过调节启动子中蛋白-DNA界面和蛋白二聚体界面，将基于邻苯二甲酸（PCA）的转录因子生物传感器从大肠杆菌优化到芳香...
An Orthogonal and pH-Tunable Sensor-Selector for Muconic Acid Biosynthesis in Yeast.
微生物在工业化学品和药物生产中具有巨大潜力，但从大型基因库中快速鉴定高产菌株仍是细胞工厂开发的主要瓶颈。本研究在酿酒酵母中构建并应用了一种正交、pH 可调的合成选择系统：将原核 LysR 型转录调控因子 BenM 与抗生素抗性基因 kanMX 偶联，使胞内/胞外粘康酸（cis,cis-muconic acid, CCM）浓度决定细胞...
Development of novel metabolite-responsive transcription factors via transposon-mediated protein fusion.
自然进化的代谢物响应生物传感器可用于代谢工程，从筛选大型基因库到动态调控生物合成途径。然而，许多代谢物没有天然生物传感器。为满足这一需求，作者开发了一种将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子的通用方法——随机结构域插入生物传感器工程（BERDI）。该方法利用体外转座子插入反应，将 DNA 结合域插入代谢物结合蛋白的所有可能位点，随...
In vivo biosensors: mechanisms, development, and applications.
体内生物传感器能够识别并响应特定细胞刺激。近年来，生物传感器越来越多地用于代谢工程和合成生物学，因为它们可被整合到合成回路中，根据特定细胞刺激（如某种代谢物或pH变化）调控报告基因表达。天然传感装置种类繁多，通常可分为蛋白质型和核酸型两大类。二者既可直接从天然遗传元件中挖掘获得，也可通过工程化改造现有遗传元件以获得新的特异性或更优性...
Design, Engineering, and Characterization of Prokaryotic Ligand-Binding Transcriptional Activators as Biosensors in Yeast.
在细胞工厂开发中，筛选步骤常依赖低通量分析方法，落后于多样性构建方法，使最优细胞工厂设计的鉴定与选择耗时且昂贵，制约制造过程。在酿酒酵母中，将原核生物别构调控转录因子作为代谢物生物传感器，是缓解该筛选瓶颈的有效策略。本文提供在酿酒酵母中筛选并整合原核转录激活因子作为代谢物生物传感器的方案。以 LysR 型转录调控因子（LTTR）家族...