Heliyon
2024
Adampourezare M, Nikzad B, Amini M, Sheibani N
本研究开发了一种基于氧化铈(CeO2)纳米颗粒的高灵敏荧光纳米生物传感器,用于快速检测 DNA 甲基化。通过透射电子显微镜(TEM)、扫描电子显微镜(SEM)、能量色散光谱(EDS)、X 射线衍射(XRD)、紫外-可见光谱和荧光光谱对 CeO2 纳米颗粒进行表征。将 CeO2 纳米颗粒与单链 DNA(ssDNA)探针反应形成 DNA...
Communications biology
2024
Brenner LM, Meyer F, Yang H, Köhler AR 等 9 人
DNA甲基化通过调控基因转录和异染色质形成影响细胞与环境的相互作用,但调控重复序列甲基化分布的胞外信号仍不清楚。重复元件富含甲基化,活细胞中研究其甲基化存在方法学困难。本研究利用基于CRISPR/dCas9荧光互补的BiAD传感器,在活细胞中实时读取人类α-卫星重复序列的DNA甲基化。作者将该传感器稳定表达于未转化乳腺上皮细胞MCF...
International journal of molecular sciences
2021
Hasegawa H, Sasaki I, Tsukakoshi K, Ma Y 等 9 人
基因组DNA甲基化参与多种疾病,有望作为疾病甚至症状前诊断的特异性生物标志物,因此需要快速、廉价的检测方法。作者此前发现G-四联体(G4)形成寡核苷酸中的胞嘧啶甲基化会诱导不同G4拓扑结构。本研究基于甲基化与非甲基化G4 DNA的结构差异,开发了一种利用G4配体检测G4形成序列中CpG甲基化的方法。CpG甲基化引起的G4拓扑差异可被...
Journal of molecular recognition : JMR
2021
Adampourezare M, Dehghan G, Hasanzadeh M, Feizi MH
由于 DNA 甲基化在癌症发生中具有重要作用,亟需高灵敏分析方法用于早期诊断和临床药物治疗。本研究开发了一种无标记光学基因传感方法,用于识别 APC 基因启动子区甲基化 DNA,并区分非甲基化 DNA 与甲基化 cDNA。该体系采用硫堇/草酸盐聚合物作为光学探针,pDNA 探针与不同 cDNA 序列杂交后,通过紫外-可见吸收和荧光光...
Chemical communications (Cambridge, England)
2021
Zhang Y, Hu J, Zou X, Ma F 等 6 人
本文报道了一种用于灵敏检测DNA甲基化的新型荧光生物传感器,该传感器将单分子检测与内切酶IV(endo IV)辅助信号放大相结合。传感器以甲基化敏感限制性内切酶HpaII判别靶DNA甲基化状态:未甲基化DNA被HpaII切割,甲基化DNA得以保留;保留的甲基化DNA链与含AP位点、5'端生物素和3'端Cy5标记的信号探针杂交,并被链...
The Analyst
2020
Chen C, He R, Zhang Z, Chen Y
本研究开发了一种基于双重识别的荧光生物传感器用于循环肿瘤DNA(ctDNA)检测,结合肽核酸(PNA)的夹持功能与小分子连接DNA末端保护(TPSMLD)策略。以PIK3CA基因肿瘤特异性E542K突变及其甲基化作为目标ctDNA,PNA修饰磁性微球在62°C选择性捕获突变序列,5-甲基胞嘧啶单克隆抗体识别甲基化位点,外切酶I/II...
RSC advances
2019
Karimi MA, Dadmehr M, Hosseini M, Korouzhdehi B 等 5 人
DNA胞嘧啶甲基化由甲基转移酶催化,参与基因表达调控;异常甲基化模式与甲基转移酶活性可作为癌症早期诊断靶标。本研究建立了一种基于FAM标记DNA与金纳米粒子(AuNPs)荧光共振能量转移(FRET)猝灭-恢复的简便检测方法,用于灵敏检测M.SssI甲基转移酶(M.SssI MTase)活性和甲基化DNA。硫醇修饰探针与AuNPs结合...
Journal of nanobiotechnology
2019
Zhang S, Huang J, Lu J, Liu M 等 10 人
DNA甲基化检测对恶性肿瘤等多种疾病的诊断和预后评估至关重要,亟需开发简便、灵敏且特异性的检测策略。本文报道了一种基于树枝状DNA纳米结构、信号富集聚苯乙烯微球与连接检测反应(LDR)相结合的新型荧光生物传感器。该传感器利用发夹结构无酶DNA催化,使Y-DNA与X-DNA自组装形成树枝状DNA聚合物,并加入补骨脂素防止高温解链;标记...
Analytica chimica acta
2017
Chen S, Ma H, Li W, Nie Z 等 5 人
基于熵驱动 toehold 介导发夹置换(ETHDA),提出一种简便、敏感的一步荧光传感平台,用于评估甲基转移酶(MTase)催化的 DNA 甲基化过程。在该体系中,发夹探针先被 DNA 腺嘌呤甲基化(Dam)MTase 甲基化,再被 DpnI 内切酶切割,释放催化链以启动信号放大。催化链触发 ETHDA 循环过程,使荧光强度增加。...
Sensors (Basel, Switzerland)
2016
Xiao L, Xu L, Gao C, Zhang Y 等 6 人
二硫化钼(MoS2)纳米材料具有与单链DNA(ss-DNA)的天然亲和力和对荧光染料的淬灭能力。本文开发了一种基于水溶性MoS2纳米片和BstUI限制性内切酶的简单荧光生物传感器,用于p16启动子DNA甲基化分析。FAM标记探针DNA(P)先与未甲基化靶DNA(T1)和甲基化靶DNA(T2)杂交形成部分双链DNA(pds-DNA),...